#dna

DNA-oligo en PCR-primer wiskunde als een API, lokaal en deterministisch berekend. Het tm-eindpunt berekent de smelttemperatuur van een primervolgorde op drie manieren: de Wallace-regel 2·(A+T) + 4·(G+C) voor korte oligo's tot 13 nt, de Marmur–Wallace GC-formule 64.9 + 41·(nGC − 16.4)/N voor langere, en de zout-aangepaste 81.5 + 0.41·%GC − 675/N + 16.6·log10[Na+] voor een gegeven natriumconcentratie, en beveelt de juiste methode aan voor de lengte — een acht-base ATGCATGC smelt bij 24 °C volgens Wallace, een 20-base 50%-GC primer bij ongeveer 51.8 °C volgens Marmur. Het gc-content eindpunt rapporteert de GC- en AT-percentages, de aantallen per base en het enkelstrengs molecuulgewicht. Het reverse-complement eindpunt geeft de complement, de reverse en het reverse complement van een streng. Sequenties gebruiken A/C/G/T (hoofdletterongevoelig, spaties genegeerd) en [Na+] is in mol/L. Alles wordt lokaal en deterministisch berekend, dus het is direct en privé. Ideaal voor ontwikkelaars van moleculaire biologie, biotech, PCR, primer-ontwerp, bioinformatica en laboratoriumautomatisering apps, oligo- en primercalculators, en LIMS-software. Schattingsformules voor primerontwerp, geen vervanging voor naaste-buur thermodynamica. Pure lokale berekening — geen sleutel, geen externe dienst, direct. Live, niets opgeslagen. 3 eindpunten. Dit is oligo smelttemperatuur; voor populatiegenetica allelfrequenties gebruik een genetica API.

api.oanor.com/dnamelt-api

DNA/RNA-sequentie-analyse wiskunde als een API, lokaal en deterministisch berekend. Het analyze-eindpunt rapporteert de lengte en basissamenstelling van een sequentie, de GC- en AT-inhoud, het complement, de reverse en het reverse complement (de tegenovergestelde streng gelezen 5'→3'), en het geschatte enkelstrengs moleculair gewicht. Het translate-eindpunt transcribeert DNA naar mRNA (T→U) en vertaalt het naar eiwit met de standaard genetische code in leesraam 1, 2 of 3, en geeft de één-letter aminozuursequentie, de eiwitlengte en het aantal stopcodons. Het melting-eindpunt schat de smelttemperatuur van een primer met de Wallace-regel, 4·(G+C) + 2·(A+T), voor korte oligo's en een zout-aangepaste basisformule voor langere. Sequenties zijn hoofdletter- en witruimte-ongevoelig en accepteren A, C, G, T voor DNA of U voor RNA. Alles wordt lokaal en deterministisch berekend, dus het is onmiddellijk en privé. Ideaal voor bioinformatica, moleculaire biologie, genomica en lab-app-ontwikkelaars, primer-ontwerp en sequentie-inspectietools, en biologie-onderwijs. Pure lokale berekening — geen sleutel, geen externe dienst, onmiddellijk. Live, niets opgeslagen. 3 eindpunten. Dit is sequentieanalyse; voor genoomassemblagegegevens gebruik een genomes API.

api.oanor.com/dna-api

De Ensembl-genoomdatabase als een API, aangedreven door de officiële Ensembl REST-service van EMBL-EBI. Zoek elk gen op via symbool of Ensembl stabiel ID voor zijn biotype, genomische locatie, streng, beschrijving en transcripten; los elk kenmerk (gen, transcript, exon) op via stabiel ID; haal externe database-verwijzingen op; haak sequentievarianten op via rsID met hun allelen, meest ernstige consequentie, frequentie van het minst voorkomende allel, klinische significantie en genomische mapping; maak een lijst van de genen, transcripten, exonen, variaties of herhalingen die overlappen met een genomische regio; verkrijg genomische, cDNA, CDS of eiwitsequenties via ID; en lees genoomassemblage-metadata inclusief het karyotype en chromosoomlengtes. Voor mens, muis en 300+ gewervelde soorten. Ideaal voor bioinformatica-pijplijnen, genoomviewers en variantannotatietools, genetisch onderzoeksapps, klinisch-genomische dashboards en levenswetenschap-chatbots.

api.oanor.com/ensembl-api