#dna

Matemática de DNA-oligo e PCR-primer como uma API, computada local e deterministicamente. O endpoint tm calcula a temperatura de fusão de uma sequência de primer de três maneiras: a regra de Wallace 2·(A+T) + 4·(G+C) para oligos curtos de até 13 nt, a fórmula GC de Marmur–Wallace 64.9 + 41·(nGC − 16.4)/N para sequências mais longas, e a ajustada por sal 81.5 + 0.41·%GC − 675/N + 16.6·log10[Na+] para uma dada concentração de sódio, e recomenda o método correto para o comprimento — um ATGCATGC de oito bases derrete a 24 °C por Wallace, um primer de 20 bases com 50% GC a cerca de 51.8 °C por Marmur. O endpoint gc-content relata as porcentagens de GC e AT, as contagens por base e o peso molecular de fita simples. O endpoint reverse-complement retorna o complemento, o reverso e o complemento reverso de uma fita. As sequências usam A/C/G/T (insensível a maiúsculas/minúsculas, espaços em branco ignorados) e [Na+] está em mol/L. Tudo é computado local e deterministicamente, então é instantâneo e privado. Ideal para desenvolvedores de aplicativos de biologia molecular, biotecnologia, PCR, design de primers, bioinformática e automação de laboratório, calculadoras de oligo e primer, e software LIMS. Fórmulas de estimativa para design de primers, não um substituto para a termodinâmica de vizinhos mais próximos. Computação puramente local — sem chave, sem serviço de terceiros, instantâneo. Ao vivo, nada armazenado. 3 endpoints. Esta é a temperatura de fusão de oligo; para frequências alélicas de genética populacional, use uma API de genética.

api.oanor.com/dnamelt-api

Matemática de análise de sequências de DNA/RNA como uma API, computada local e deterministicamente. O endpoint analyze relata o comprimento e a composição de bases de uma sequência, o conteúdo GC e AT, o complemento, o reverso e o complemento reverso (a fita oposta lida 5'→3'), e o peso molecular aproximado de fita simples. O endpoint translate transcreve DNA para mRNA (T→U) e o traduz para proteína com o código genético padrão no quadro de leitura 1, 2 ou 3, fornecendo a sequência de aminoácidos em código de uma letra, o comprimento da proteína e o número de códons de parada. O endpoint melting estima a temperatura de melting de um primer com a regra de Wallace, 4·(G+C) + 2·(A+T), para oligonucleotídeos curtos e uma fórmula básica ajustada por sal para os mais longos. As sequências são insensíveis a maiúsculas/minúsculas e espaços em branco e aceitam A, C, G, T para DNA ou U para RNA. Tudo é computado local e deterministicamente, portanto é instantâneo e privado. Ideal para bioinformática, biologia molecular, genômica e desenvolvedores de aplicativos de laboratório, ferramentas de design de primers e inspeção de sequências, e educação em biologia. Computação puramente local — sem chave, sem serviço de terceiros, instantâneo. Ao vivo, nada armazenado. 3 endpoints. Esta é análise de sequência; para dados de montagem de genoma, use uma API de genomas.

api.oanor.com/dna-api

The Ensembl genome database as an API, powered by the official Ensembl REST service from EMBL-EBI. Look up any gene by symbol or Ensembl stable id for its biotype, genomic location, strand, description and transcripts; resolve any feature (gene, transcript, exon) by stable id; pull external database cross-references; fetch sequence variants by rsID with their alleles, most-severe consequence, minor-allele frequency, clinical significance and genomic mappings; list the genes, transcripts, exons, variations or repeats overlapping any genomic region; retrieve genomic, cDNA, CDS or protein sequences by id; and read genome-assembly metadata including the karyotype and chromosome lengths. Across human, mouse and 300+ vertebrate species. Ideal for bioinformatics pipelines, genome browsers and variant-annotation tools, genetics research apps, clinical-genomics dashboards and life-science chatbots.

api.oanor.com/ensembl-api