#dna

Μαθηματικά DNA-ολιγονουκλεοτιδίων και PCR-εκκινητών ως API, υπολογιζόμενα τοπικά και ντετερμινιστικά. Το τελικό σημείο tm υπολογίζει τη θερμοκρασία τήξης μιας αλληλουχίας εκκινητή με τρεις τρόπους: τον κανόνα Wallace 2·(A+T) + 4·(G+C) για μικρά ολιγονουκλεοτίδια έως 13 νουκλεοτίδια, τον τύπο GC Marmur–Wallace 64.9 + 41·(nGC − 16.4)/N για μεγαλύτερα, και τον προσαρμοσμένο σε άλας 81.5 + 0.41·%GC − 675/N + 16.6·log10[Na+] για δεδομένη συγκέντρωση νατρίου, και προτείνει τη σωστή μέθοδο για το μήκος — ένα οκταμερές ATGCATGC τήκεται στους 24 °C κατά Wallace, ένας εκκινητής 20 βάσεων με 50 % GC στους περίπου 51.8 °C κατά Marmur. Το τελικό σημείο gc-content αναφέρει τα ποσοστά GC και AT, τις μετρήσεις ανά βάση και το μοριακό βάρος μονής αλυσίδας. Το τελικό σημείο reverse-complement επιστρέφει το συμπλήρωμα, την αντιστροφή και το αντίστροφο συμπλήρωμα μιας αλυσίδας. Οι αλληλουχίες χρησιμοποιούν A/C/G/T (χωρίς διάκριση πεζών-κεφαλαίων, τα κενά αγνοούνται) και [Na+] σε mol/L. Όλα υπολογίζονται τοπικά και ντετερμινιστικά, επομένως είναι άμεσα και ιδιωτικά. Ιδανικό για προγραμματιστές εφαρμογών μοριακής βιολογίας, βιοτεχνολογίας, PCR, σχεδιασμού εκκινητών, βιοπληροφορικής και εργαστηριακού αυτοματισμού, υπολογιστές ολιγονουκλεοτιδίων και εκκινητών, και λογισμικό LIMS. Τύποι εκτίμησης για σχεδιασμό εκκινητών, όχι υποκατάστατο της θερμοδυναμικής πλησιέστερου γείτονα. Καθαρός τοπικός υπολογισμός — χωρίς κλειδί, χωρίς υπηρεσία τρίτου, άμεσο. Ζωντανό, τίποτα δεν αποθηκεύεται. 3 τελικά σημεία. Αυτή είναι θερμοκρασία τήξης ολιγονουκλεοτιδίων· για συχνότητες αλληλόμορφων πληθυσμιακής γενετικής χρησιμοποιήστε ένα API γενετικής.

api.oanor.com/dnamelt-api

Μαθηματικά ανάλυσης αλληλουχίας DNA/RNA ως API, υπολογισμένα τοπικά και ντετερμινιστικά. Το τελικό σημείο analyze αναφέρει το μήκος και τη σύνθεση βάσεων μιας αλληλουχίας, την περιεκτικότητα GC και AT, το συμπλήρωμα, το αντίστροφο και το αντίστροφο συμπλήρωμα (το αντίθετο νήμα που διαβάζεται 5'→3'), και το κατά προσέγγιση μοριακό βάρος μονής αλυσίδας. Το τελικό σημείο translate μεταγράφει DNA σε mRNA (T→U) και το μεταφράζει σε πρωτεΐνη με τον τυπικό γενετικό κώδικα στο πλαίσιο ανάγνωσης 1, 2 ή 3, δίνοντας την αλληλουχία αμινοξέων με ένα γράμμα, το μήκος πρωτεΐνης και τον αριθμό των κωδικονίων λήξης. Το τελικό σημείο melting εκτιμά τη θερμοκρασία τήξης ενός εκκινητή με τον κανόνα Wallace, 4·(G+C) + 2·(A+T), για μικρά ολιγονουκλεοτίδια και έναν βασικό τύπο προσαρμοσμένο σε άλατα για μεγαλύτερα. Οι αλληλουχίες δεν κάνουν διάκριση πεζών-κεφαλαίων και κενών και δέχονται A, C, G, T για DNA ή U για RNA. Όλα υπολογίζονται τοπικά και ντετερμινιστικά, επομένως είναι άμεσα και ιδιωτικά. Ιδανικό για βιοπληροφορική, μοριακή βιολογία, γονιδιωματική και προγραμματιστές εργαστηριακών εφαρμογών, εργαλεία σχεδιασμού εκκινητών και επιθεώρησης αλληλουχιών, και εκπαίδευση βιολογίας. Καθαρός τοπικός υπολογισμός — χωρίς κλειδί, χωρίς υπηρεσία τρίτου μέρους, άμεσο. Ζωντανό, τίποτα δεν αποθηκεύεται. 3 τελικά σημεία. Αυτή είναι ανάλυση αλληλουχίας· για δεδομένα συναρμολόγησης γονιδιώματος χρησιμοποιήστε ένα API γονιδιωμάτων.

api.oanor.com/dna-api

Η βάση δεδομένων γονιδιώματος Ensembl ως API, που υποστηρίζεται από την επίσημη υπηρεσία REST Ensembl του EMBL-EBI. Αναζητήστε οποιοδήποτε γονίδιο με σύμβολο ή σταθερό αναγνωριστικό Ensembl για τον βιότυπο, τη γονιδιωματική θέση, τον κλώνο, την περιγραφή και τα μεταγραφήματά του· εντοπίστε οποιοδήποτε χαρακτηριστικό (γονίδιο, μεταγράφημα, εξώνιο) με σταθερό αναγνωριστικό· ανακτήστε διασταυρούμενες αναφορές εξωτερικών βάσεων δεδομένων· λάβετε παραλλαγές αλληλουχίας με rsID, τα αλληλόμορφά τους, την πιο σοβαρή συνέπεια, τη συχνότητα του σπάνιου αλληλόμορφου, την κλινική σημασία και τις γονιδιωματικές αντιστοιχίσεις· καταγράψτε τα γονίδια, μεταγραφήματα, εξώνια, παραλλαγές ή επαναλήψεις που επικαλύπτουν οποιαδήποτε γονιδιωματική περιοχή· ανακτήστε γονιδιωματικές, cDNA, CDS ή πρωτεϊνικές αλληλουχίες με αναγνωριστικό· και διαβάστε μεταδεδομένα συναρμολόγησης γονιδιώματος, συμπεριλαμβανομένων του καρυότυπου και των μηκών χρωμοσωμάτων. Σε ανθρώπους, ποντίκια και 300+ είδη σπονδυλωτών. Ιδανικό για βιοπληροφορικές σωληνώσεις, περιηγητές γονιδιώματος και εργαλεία σχολιασμού παραλλαγών, εφαρμογές έρευνας γενετικής, πίνακες ελέγχου κλινικής γονιδιωματικής και chatbots επιστημών ζωής.

api.oanor.com/ensembl-api