#dna

Matemáticas de ADN-oligo y PCR-primer como una API, calculadas local y determinísticamente. El endpoint tm calcula la temperatura de fusión de una secuencia de cebador de tres maneras: la regla de Wallace 2·(A+T) + 4·(G+C) para oligos cortos de hasta 13 nt, la fórmula GC de Marmur–Wallace 64.9 + 41·(nGC − 16.4)/N para los más largos, y la ajustada por sal 81.5 + 0.41·%GC − 675/N + 16.6·log10[Na+] para una concentración de sodio dada, y recomienda el método adecuado para la longitud — un ATGCATGC de ocho bases se funde a 24 °C según Wallace, un cebador de 20 bases con 50 % de GC a aproximadamente 51.8 °C según Marmur. El endpoint gc-content informa los porcentajes de GC y AT, los recuentos por base y el peso molecular de cadena sencilla. El endpoint reverse-complement devuelve el complemento, la reversa y el complemento reverso de una hebra. Las secuencias usan A/C/G/T (sin distinción de mayúsculas/minúsculas, se ignoran espacios en blanco) y [Na+] está en mol/L. Todo se calcula local y determinísticamente, por lo que es instantáneo y privado. Ideal para desarrolladores de aplicaciones de biología molecular, biotecnología, PCR, diseño de cebadores, bioinformática y automatización de laboratorio, calculadoras de oligos y cebadores, y software LIMS. Fórmulas de estimación para diseño de cebadores, no un sustituto de la termodinámica de vecinos más cercanos. Cálculo local puro — sin clave, sin servicio de terceros, instantáneo. En vivo, nada almacenado. 3 endpoints. Esto es temperatura de fusión de oligos; para frecuencias alélicas de genética de poblaciones use una API de genética.

api.oanor.com/dnamelt-api

Matemáticas de análisis de secuencias de ADN/ARN como API, calculadas local y deterministicamente. El endpoint analyze informa la longitud y composición de bases de una secuencia, el contenido GC y AT, el complemento, la reversa y el complemento reverso (la hebra opuesta leída 5'→3'), y el peso molecular aproximado de cadena simple. El endpoint translate transcribe ADN a ARNm (T→U) y lo traduce a proteína con el código genético estándar en el marco de lectura 1, 2 o 3, dando la secuencia de aminoácidos en código de una letra, la longitud de la proteína y el número de codones de parada. El endpoint melting estima la temperatura de fusión de un cebador con la regla de Wallace, 4·(G+C) + 2·(A+T), para oligos cortos y una fórmula básica ajustada por sal para los más largos. Las secuencias no distinguen entre mayúsculas y minúsculas ni espacios en blanco y aceptan A, C, G, T para ADN o U para ARN. Todo se calcula local y deterministicamente, por lo que es instantáneo y privado. Ideal para desarrolladores de aplicaciones de bioinformática, biología molecular, genómica y laboratorio, herramientas de diseño de cebadores e inspección de secuencias, y educación en biología. Cálculo local puro — sin clave, sin servicio de terceros, instantáneo. En vivo, nada almacenado. 3 endpoints. Esto es análisis de secuencias; para datos de ensamblaje de genomas use una API de genomas.

api.oanor.com/dna-api

La base de datos del genoma Ensembl como API, impulsada por el servicio REST oficial de Ensembl de EMBL-EBI. Busque cualquier gen por símbolo o ID estable de Ensembl para obtener su biotipo, ubicación genómica, cadena, descripción y transcritos; resuelva cualquier característica (gen, transcrito, exón) por ID estable; obtenga referencias cruzadas de bases de datos externas; recupere variantes de secuencia por rsID con sus alelos, consecuencia más grave, frecuencia del alelo menor, significado clínico y mapeos genómicos; liste los genes, transcritos, exones, variaciones o repeticiones que se superponen con cualquier región genómica; recupere secuencias genómicas, de ADNc, CDS o de proteínas por ID; y lea metadatos del ensamblaje del genoma, incluidos el cariotipo y las longitudes de los cromosomas. En humano, ratón y más de 300 especies de vertebrados. Ideal para tuberías de bioinformática, navegadores de genoma y herramientas de anotación de variantes, aplicaciones de investigación genética, paneles de genómica clínica y chatbots de ciencias de la vida.

api.oanor.com/ensembl-api