#sequence

Mathématiques d'analyse de séquences ADN/ARN sous forme d'API, calculées localement et de manière déterministe. Le point de terminaison analyze rapporte la longueur et la composition en bases d'une séquence, le contenu GC et AT, le complément, l'inverse et le complément inverse (le brin opposé lu 5'→3'), et le poids moléculaire approximatif simple brin. Le point de terminaison translate transcrit l'ADN en ARNm (T→U) et le traduit en protéine avec le code génétique standard dans le cadre de lecture 1, 2 ou 3, donnant la séquence d'acides aminés en une lettre, la longueur de la protéine et le nombre de codons stop. Le point de terminaison melting estime la température de fusion d'une amorce avec la règle de Wallace, 4·(G+C) + 2·(A+T), pour les oligos courts et une formule de base ajustée au sel pour les plus longs. Les séquences sont insensibles à la casse et aux espaces et acceptent A, C, G, T pour l'ADN ou U pour l'ARN. Tout est calculé localement et de manière déterministe, donc instantané et privé. Idéal pour la bioinformatique, la biologie moléculaire, la génomique et les développeurs d'applications de laboratoire, les outils de conception d'amorces et d'inspection de séquences, et l'enseignement de la biologie. Calcul local pur — pas de clé, pas de service tiers, instantané. En direct, rien n'est stocké. 3 points de terminaison. Ceci est une analyse de séquence ; pour les données d'assemblage de génome, utilisez une API génomes.

api.oanor.com/dna-api

La base de connaissances protéiques UniProt sous forme d'API, propulsée par le service REST officiel d'UniProt, organisé par EMBL-EBI, SIB et PIR. Recherchez n'importe quelle protéine par son accession UniProt pour obtenir les noms de protéines et de gènes, l'organisme, la longueur, la masse, la fonction, les mots-clés, les termes Gene Ontology (GO) et les structures 3D PDB liées ; effectuez des recherches en texte intégral de protéines filtrées par organisme (identifiant taxonomique NCBI) et par statut de révision Swiss-Prot ; récupérez les séquences d'acides aminés avec FASTA, le poids moléculaire et la somme de contrôle CRC64 ; listez les caractéristiques de séquence telles que les peptides signaux, les chaînes, les domaines, les sites actifs et de liaison, les résidus modifiés et les variants naturels, avec une répartition par type ; résolvez les nœuds de taxonomie NCBI avec leur lignée complète ; et extrayez les protéomes de référence avec les comptes de protéines et les identifiants d'assemblage du génome. Dans tous les règnes du vivant, de l'humain aux bactéries. Idéal pour les pipelines bioinformatiques, les outils de découverte de médicaments et de protéomique, les tableaux de bord d'analyse de séquences, les applications de recherche académique et les chatbots en sciences de la vie.

api.oanor.com/uniprot-api