#sequence
2 APIs con esta etiqueta
API de Secuencia de ADN
Matemáticas de análisis de secuencias de ADN/ARN como API, calculadas local y deterministicamente. El endpoint analyze informa la longitud y composición de bases de una secuencia, el contenido GC y AT, el complemento, la reversa y el complemento reverso (la hebra opuesta leída 5'→3'), y el peso molecular aproximado de cadena simple. El endpoint translate transcribe ADN a ARNm (T→U) y lo traduce a proteína con el código genético estándar en el marco de lectura 1, 2 o 3, dando la secuencia de aminoácidos en código de una letra, la longitud de la proteína y el número de codones de parada. El endpoint melting estima la temperatura de fusión de un cebador con la regla de Wallace, 4·(G+C) + 2·(A+T), para oligos cortos y una fórmula básica ajustada por sal para los más largos. Las secuencias no distinguen entre mayúsculas y minúsculas ni espacios en blanco y aceptan A, C, G, T para ADN o U para ARN. Todo se calcula local y deterministicamente, por lo que es instantáneo y privado. Ideal para desarrolladores de aplicaciones de bioinformática, biología molecular, genómica y laboratorio, herramientas de diseño de cebadores e inspección de secuencias, y educación en biología. Cálculo local puro — sin clave, sin servicio de terceros, instantáneo. En vivo, nada almacenado. 3 endpoints. Esto es análisis de secuencias; para datos de ensamblaje de genomas use una API de genomas.
api.oanor.com/dna-api
API de UniProt
La base de conocimiento de proteínas UniProt como API, impulsada por el servicio REST oficial de UniProt curado por EMBL-EBI, SIB y PIR. Busque cualquier proteína por su acceso UniProt para nombres de proteínas y genes, organismo, longitud, masa, función, palabras clave, términos de Gene Ontology (GO) y estructuras 3D de PDB vinculadas; realice búsquedas de texto completo de proteínas filtradas por organismo (ID de taxón NCBI) y estado de revisión Swiss-Prot; obtenga secuencias de aminoácidos con FASTA, peso molecular y suma de verificación CRC64; enumere características de secuencia como péptidos señal, cadenas, dominios, sitios activos y de unión, residuos modificados y variantes naturales, con un desglose por tipo; resuelva nodos de taxonomía NCBI con su linaje completo; y extraiga proteomas de referencia con recuentos de proteínas e IDs de ensamblaje del genoma. En todos los reinos de la vida, desde humanos hasta bacterias. Ideal para tuberías de bioinformática, herramientas de descubrimiento de fármacos y proteómica, paneles de análisis de secuencias, aplicaciones de investigación académica y chatbots de ciencias de la vida.
api.oanor.com/uniprot-api