Πίσω

#sequence

2 API με αυτήν την ετικέτα

API Αλληλουχίας DNA

Μαθηματικά ανάλυσης αλληλουχίας DNA/RNA ως API, υπολογισμένα τοπικά και ντετερμινιστικά. Το τελικό σημείο analyze αναφέρει το μήκος και τη σύνθεση βάσεων μιας αλληλουχίας, την περιεκτικότητα GC και AT, το συμπλήρωμα, το αντίστροφο και το αντίστροφο συμπλήρωμα (το αντίθετο νήμα που διαβάζεται 5'→3'), και το κατά προσέγγιση μοριακό βάρος μονής αλυσίδας. Το τελικό σημείο translate μεταγράφει DNA σε mRNA (T→U) και το μεταφράζει σε πρωτεΐνη με τον τυπικό γενετικό κώδικα στο πλαίσιο ανάγνωσης 1, 2 ή 3, δίνοντας την αλληλουχία αμινοξέων με ένα γράμμα, το μήκος πρωτεΐνης και τον αριθμό των κωδικονίων λήξης. Το τελικό σημείο melting εκτιμά τη θερμοκρασία τήξης ενός εκκινητή με τον κανόνα Wallace, 4·(G+C) + 2·(A+T), για μικρά ολιγονουκλεοτίδια και έναν βασικό τύπο προσαρμοσμένο σε άλατα για μεγαλύτερα. Οι αλληλουχίες δεν κάνουν διάκριση πεζών-κεφαλαίων και κενών και δέχονται A, C, G, T για DNA ή U για RNA. Όλα υπολογίζονται τοπικά και ντετερμινιστικά, επομένως είναι άμεσα και ιδιωτικά. Ιδανικό για βιοπληροφορική, μοριακή βιολογία, γονιδιωματική και προγραμματιστές εργαστηριακών εφαρμογών, εργαλεία σχεδιασμού εκκινητών και επιθεώρησης αλληλουχιών, και εκπαίδευση βιολογίας. Καθαρός τοπικός υπολογισμός — χωρίς κλειδί, χωρίς υπηρεσία τρίτου μέρους, άμεσο. Ζωντανό, τίποτα δεν αποθηκεύεται. 3 τελικά σημεία. Αυτή είναι ανάλυση αλληλουχίας· για δεδομένα συναρμολόγησης γονιδιώματος χρησιμοποιήστε ένα API γονιδιωμάτων.

api.oanor.com/dna-api

UniProt API

Η βάση γνώσης πρωτεϊνών UniProt ως API, που υποστηρίζεται από την επίσημη υπηρεσία REST UniProt που επιμελούνται οι EMBL-EBI, SIB και PIR. Αναζητήστε οποιαδήποτε πρωτεΐνη με το αναγνωριστικό UniProt για ονόματα πρωτεϊνών και γονιδίων, οργανισμό, μήκος, μάζα, λειτουργία, λέξεις-κλειδιά, όρους Gene Ontology (GO) και συνδεδεμένες τρισδιάστατες δομές PDB· εκτελέστε αναζητήσεις πλήρους κειμένου πρωτεϊνών φιλτραρισμένες ανά οργανισμό (αναγνωριστικό ταξινομίας NCBI) και κατάσταση αναθεώρησης Swiss-Prot· λάβετε αλληλουχίες αμινοξέων με FASTA, μοριακό βάρος και άθροισμα ελέγχου CRC64· καταγράψτε χαρακτηριστικά αλληλουχίας όπως πεπτίδια σήματος, αλυσίδες, τομείς, ενεργές θέσεις και θέσεις δέσμευσης, τροποποιημένα κατάλοιπα και φυσικές παραλλαγές, με ανάλυση ανά τύπο· επιλύστε κόμβους ταξινομίας NCBI με την πλήρη γενεαλογία τους· και αντλήστε πρωτεώματα αναφοράς με μετρήσεις πρωτεϊνών και αναγνωριστικά συναρμολόγησης γονιδιώματος. Σε όλα τα βασίλεια της ζωής, από τον άνθρωπο έως τα βακτήρια. Ιδανικό για βιοπληροφορικές σωληνώσεις, εργαλεία ανακάλυψης φαρμάκων και πρωτεωμικής, πίνακες ελέγχου ανάλυσης αλληλουχιών, εφαρμογές ακαδημαϊκής έρευνας και chatbots επιστημών ζωής.

api.oanor.com/uniprot-api