Rug

#sequence

2 APIs met deze tag

DNA Sequence API

DNA/RNA-sequentie-analyse wiskunde als een API, lokaal en deterministisch berekend. Het analyze-eindpunt rapporteert de lengte en basissamenstelling van een sequentie, de GC- en AT-inhoud, het complement, de reverse en het reverse complement (de tegenovergestelde streng gelezen 5'→3'), en het geschatte enkelstrengs moleculair gewicht. Het translate-eindpunt transcribeert DNA naar mRNA (T→U) en vertaalt het naar eiwit met de standaard genetische code in leesraam 1, 2 of 3, en geeft de één-letter aminozuursequentie, de eiwitlengte en het aantal stopcodons. Het melting-eindpunt schat de smelttemperatuur van een primer met de Wallace-regel, 4·(G+C) + 2·(A+T), voor korte oligo's en een zout-aangepaste basisformule voor langere. Sequenties zijn hoofdletter- en witruimte-ongevoelig en accepteren A, C, G, T voor DNA of U voor RNA. Alles wordt lokaal en deterministisch berekend, dus het is onmiddellijk en privé. Ideaal voor bioinformatica, moleculaire biologie, genomica en lab-app-ontwikkelaars, primer-ontwerp en sequentie-inspectietools, en biologie-onderwijs. Pure lokale berekening — geen sleutel, geen externe dienst, onmiddellijk. Live, niets opgeslagen. 3 eindpunten. Dit is sequentieanalyse; voor genoomassemblagegegevens gebruik een genomes API.

api.oanor.com/dna-api

UniProt API

De UniProt-eiwitkennisdatabase als een API, aangedreven door de officiële UniProt REST-service, samengesteld door EMBL-EBI, SIB en PIR. Zoek elk eiwit op via zijn UniProt-toegangsnummer voor eiwit- en gennamen, organisme, lengte, massa, functie, trefwoorden, Gene Ontology (GO)-termen en gekoppelde PDB 3D-structuren; voer full-text eiwitzoekopdrachten uit, gefilterd op organisme (NCBI-taxon-id) en Swiss-Prot-beoordelingsstatus; haal aminozuursequenties op met FASTA, molecuulgewicht en CRC64-checksum; vermeld sequentiekenmerken zoals signaalpeptiden, ketens, domeinen, actieve en bindingsplaatsen, gemodificeerde residuen en natuurlijke varianten, met een uitsplitsing per type; los NCBI-taxonomieknooppunten op met hun volledige afstamming; en haal referentieproteomen op met eiwitaantallen en genoomassemblage-ID's. Over alle rijken van het leven, van mens tot bacterie. Ideaal voor bioinformatica-pijplijnen, geneesmiddelenontdekking en proteomicatools, sequentieanalyse-dashboards, academische onderzoeksapps en levenswetenschap-chatbots.

api.oanor.com/uniprot-api