#sequence
2 APIs con questa etichetta
API de Sequência de DNA
Matemática de análise de sequências de DNA/RNA como uma API, computada local e deterministicamente. O endpoint analyze relata o comprimento e a composição de bases de uma sequência, o conteúdo GC e AT, o complemento, o reverso e o complemento reverso (a fita oposta lida 5'→3'), e o peso molecular aproximado de fita simples. O endpoint translate transcreve DNA para mRNA (T→U) e o traduz para proteína com o código genético padrão no quadro de leitura 1, 2 ou 3, fornecendo a sequência de aminoácidos em código de uma letra, o comprimento da proteína e o número de códons de parada. O endpoint melting estima a temperatura de melting de um primer com a regra de Wallace, 4·(G+C) + 2·(A+T), para oligonucleotídeos curtos e uma fórmula básica ajustada por sal para os mais longos. As sequências são insensíveis a maiúsculas/minúsculas e espaços em branco e aceitam A, C, G, T para DNA ou U para RNA. Tudo é computado local e deterministicamente, portanto é instantâneo e privado. Ideal para bioinformática, biologia molecular, genômica e desenvolvedores de aplicativos de laboratório, ferramentas de design de primers e inspeção de sequências, e educação em biologia. Computação puramente local — sem chave, sem serviço de terceiros, instantâneo. Ao vivo, nada armazenado. 3 endpoints. Esta é análise de sequência; para dados de montagem de genoma, use uma API de genomas.
api.oanor.com/dna-api
UniProt API
The UniProt protein knowledge base as an API, powered by the official UniProt REST service curated by EMBL-EBI, SIB and PIR. Look up any protein by its UniProt accession for protein and gene names, organism, length, mass, function, keywords, Gene Ontology (GO) terms and linked PDB 3D structures; run full-text protein searches filtered by organism (NCBI taxon id) and Swiss-Prot review status; fetch amino-acid sequences with FASTA, molecular weight and CRC64 checksum; list sequence features such as signal peptides, chains, domains, active and binding sites, modified residues and natural variants, with a by-type breakdown; resolve NCBI taxonomy nodes with their full lineage; and pull reference proteomes with protein counts and genome-assembly ids. Across all kingdoms of life, from human to bacteria. Ideal for bioinformatics pipelines, drug-discovery and proteomics tools, sequence-analysis dashboards, academic research apps and life-science chatbots.
api.oanor.com/uniprot-api