A full UniProtKB protein entry
API · /uniprot-api
API UniProt
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La base de connaissances protéiques UniProt sous forme d'API, propulsée par le service REST officiel d'UniProt, organisé par EMBL-EBI, SIB et PIR. Recherchez n'importe quelle protéine par son accession UniProt pour obtenir les noms de protéines et de gènes, l'organisme, la longueur, la masse, la fonction, les mots-clés, les termes Gene Ontology (GO) et les structures 3D PDB liées ; effectuez des recherches en texte intégral de protéines filtrées par organisme (identifiant taxonomique NCBI) et par statut de révision Swiss-Prot ; récupérez les séquences d'acides aminés avec FASTA, le poids moléculaire et la somme de contrôle CRC64 ; listez les caractéristiques de séquence telles que les peptides signaux, les chaînes, les domaines, les sites actifs et de liaison, les résidus modifiés et les variants naturels, avec une répartition par type ; résolvez les nœuds de taxonomie NCBI avec leur lignée complète ; et extrayez les protéomes de référence avec les comptes de protéines et les identifiants d'assemblage du génome. Dans tous les règnes du vivant, de l'humain aux bactéries. Idéal pour les pipelines bioinformatiques, les outils de découverte de médicaments et de protéomique, les tableaux de bord d'analyse de séquences, les applications de recherche académique et les chatbots en sciences de la vie.
api.oanor.com/uniprot-api
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Connexes APIs
Autres APIs avec des balises qui se chevauchent.
API de température de fusion de l'ADN
Calculs d'ADN-oligo et d'amorce PCR sous forme d'API, calculés localement et de manière déterministe. Le point de terminaison tm calcule la température de fusion d'une séquence d'amorce de trois manières : la règle de Wallace 2·(A+T) + 4·(G+C) pour les oligos courts jusqu'à 13 nt, la formule GC de Marmur–Wallace 64.9 + 41·(nGC − 16.4)/N pour les plus longs, et la formule ajustée au sel 81.5 + 0.41·%GC − 675/N + 16.6·log10[Na+] pour une concentration de sodium donnée, et recommande la méthode appropriée pour la longueur — un ATGCATGC de huit bases fond à 24 °C selon Wallace, une amorce de 20 bases à 50 % de GC à environ 51.8 °C selon Marmur. Le point de terminaison gc-content rapporte les pourcentages GC et AT, les comptes par base et le poids moléculaire simple brin. Le point de terminaison reverse-complement renvoie le complément, l'inverse et le complément inverse d'un brin. Les séquences utilisent A/C/G/T (insensible à la casse, les espaces ignorés) et [Na+] est en mol/L. Tout est calculé localement et de manière déterministe, donc instantané et privé. Idéal pour les développeurs d'applications en biologie moléculaire, biotechnologie, PCR, conception d'amorces, bioinformatique et automatisation de laboratoire, les calculateurs d'oligo et d'amorce, et les logiciels LIMS. Formules d'estimation pour la conception d'amorces, ne remplace pas la thermodynamique des plus proches voisins. Calcul local pur — pas de clé, pas de service tiers, instantané. En direct, rien n'est stocké. 3 points de terminaison. Ceci est la température de fusion des oligos ; pour les fréquences alléliques en génétique des populations, utilisez une API de génétique.
api.oanor.com/dnamelt-api
API de séquence ADN
Mathématiques d'analyse de séquences ADN/ARN sous forme d'API, calculées localement et de manière déterministe. Le point de terminaison analyze rapporte la longueur et la composition en bases d'une séquence, le contenu GC et AT, le complément, l'inverse et le complément inverse (le brin opposé lu 5'→3'), et le poids moléculaire approximatif simple brin. Le point de terminaison translate transcrit l'ADN en ARNm (T→U) et le traduit en protéine avec le code génétique standard dans le cadre de lecture 1, 2 ou 3, donnant la séquence d'acides aminés en une lettre, la longueur de la protéine et le nombre de codons stop. Le point de terminaison melting estime la température de fusion d'une amorce avec la règle de Wallace, 4·(G+C) + 2·(A+T), pour les oligos courts et une formule de base ajustée au sel pour les plus longs. Les séquences sont insensibles à la casse et aux espaces et acceptent A, C, G, T pour l'ADN ou U pour l'ARN. Tout est calculé localement et de manière déterministe, donc instantané et privé. Idéal pour la bioinformatique, la biologie moléculaire, la génomique et les développeurs d'applications de laboratoire, les outils de conception d'amorces et d'inspection de séquences, et l'enseignement de la biologie. Calcul local pur — pas de clé, pas de service tiers, instantané. En direct, rien n'est stocké. 3 points de terminaison. Ceci est une analyse de séquence ; pour les données d'assemblage de génome, utilisez une API génomes.
api.oanor.com/dna-api
API des assemblages de génomes
Assemblages de génomes de référence sous forme d'API — alimentée par NCBI Assembly, le registre des constructions de génomes pour les organismes de l'arbre de la vie. Recherchez des assemblages par organisme (ou texte libre) et consultez les métadonnées de tout assemblage : son accession (GCF_… RefSeq ou GCA_… GenBank), son nom (par exemple GRCh38.p14), l'organisme et l'identifiant taxonomique, le niveau d'assemblage (génome complet, chromosome, échafaudage ou contig), les statistiques de contiguïté (N50 des contigs et des échafaudages), la couverture de séquençage, la catégorie RefSeq, les noms UCSC et Ensembl, l'organisation soumettrice, la date de publication et les chemins de téléchargement FTP. Du génome de référence humain à tout microbe, plante ou animal séquencé, il transforme le registre des assemblages de génomes en une API propre de recherche et de récupération. Un registre d'assemblages de génomes — distinct des bases de données de séquences (ENA), d'annotation de génomes (Ensembl), de variants (ClinVar, dbVar) et d'expression génique (GEO). Données ouvertes de NCBI Assembly (domaine public).
api.oanor.com/genomes-api
API d'expression génique
Expériences de génomique fonctionnelle sous forme d'API — propulsée par NCBI GEO (Gene Expression Omnibus), le plus grand référentiel public de données d'expression génique. GEO archive des séries d'expression et des ensembles de données organisés provenant d'expériences de puces à ADN et de séquençage à haut débit pour chaque organisme. Recherchez des expériences par mot-clé et éventuellement par organisme, et consultez toute série ou ensemble de données pour obtenir ses métadonnées : titre, résumé, type de test (profilage d'expression par puce ou par séquençage), organisme, nombre d'échantillons, plateforme et publication associée. Des études sur le stress des cellules β à la transcriptomique du cancer chez l'humain et la souris, il transforme l'archive GEO en une API simple de recherche et de récupération pour la transcriptomique, la bioinformatique et la découverte de données de recherche. Un référentiel de données d'expression génique / génomique fonctionnelle — distinct des bases de données de séquences (ENA), de variants (ClinVar, dbVar), de structures (PDB) et d'ontologies. Données ouvertes de NCBI GEO (domaine public).
api.oanor.com/geodatasets-api
Questions fréquentes
Réponses rapides sur les tarifs, quotas et l'intégration.
Comment obtenir une clé API pour API UniProt ?
Inscris-toi gratuitement sur oanor.com, génère une clé API depuis le tableau de bord développeur et appelle API UniProt avec l'en-tête x-oanor-key. Aucune carte bancaire requise pour le forfait gratuit.
Quelle est la limite de débit de API UniProt ?
Le forfait gratuit permet 1 requête par seconde. Les forfaits payants montent jusqu'à 50 requêtes par seconde sur le palier Mega. Les limites strictes renvoient HTTP 429 au-delà du quota — sans frais surprises.
Combien coûte API UniProt ?
API UniProt dispose d'un forfait gratuit avec 100 appels / mois. Les forfaits payants commencent à €6.90 / mois avec des quotas plus élevés et des limites de débit plus rapides.
Puis-je résilier mon abonnement à tout moment ?
Oui. Les abonnements sont facturés mensuellement et tu peux résilier à tout moment depuis le tableau de bord de facturation. Aucun engagement à long terme ni frais de résiliation.
API UniProt est-il conforme au RGPD ?
Toutes les requêtes vers API UniProt transitent par notre passerelle européenne. Ta clé API upstream ne quitte jamais notre serveur et aucune donnée personnelle n'est partagée avec le fournisseur upstream au-delà de la requête envoyée.
Choisissez un point de terminaison dans la liste de gauche pour voir ses détails et essayez-le.
Extraits de code
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curl https://api.oanor.com/uniprot-api/SOME_PATH \
-H "x-oanor-key: oanor_test_..."const res = await fetch("https://api.oanor.com/uniprot-api/SOME_PATH", {
headers: { "x-oanor-key": "oanor_test_..." }
});
const data = await res.json();$ch = curl_init("https://api.oanor.com/uniprot-api/SOME_PATH");
curl_setopt($ch, CURLOPT_RETURNTRANSFER, true);
curl_setopt($ch, CURLOPT_HTTPHEADER, ["x-oanor-key: oanor_test_..."]);
$response = curl_exec($ch);import requests
r = requests.get(
"https://api.oanor.com/uniprot-api/SOME_PATH",
headers={"x-oanor-key": "oanor_test_..."},
)
print(r.json())Notes
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