oanor
Δωρεάν εγγραφή
Αγορά Τιμές Λειτουργίες Σύνδεση

API · /rfam-api

API Rfam

υγιής 4,715 Συνδρομητές

Η βάση δεδομένων Rfam οικογενειών μη-κωδικοποιητικών RNA ως API, με την υποστήριξη του EMBL-EBI. Το Rfam ομαδοποιεί λειτουργικά RNA που μοιράζονται μια κοινή εξελικτική προέλευση σε οικογένειες, κάθε μία από τις οποίες μοντελοποιείται από ένα μοντέλο συνδιακύμανσης που βασίζεται σε μια επιμελημένη στοίχιση σπόρων και δευτεροταγή δομή. Αναζητήστε τις οικογένειες με όνομα, περιγραφή ή τύπο RNA — ριβοδιακόπτες και άλλα ρυθμιστικά στοιχεία cis, ριβοένζυμα, οικογένειες microRNA, ριβοσωμικά RNA, μεταφορικά RNA, μικρά πυρηνικά και μικρά πυρηνιδιακά RNA, μακρά μη-κωδικοποιητικά RNA και άμεσες επαναλήψεις CRISPR — λαμβάνοντας για κάθε οικογένεια το αναγνωριστικό Rfam, το όνομα, την περιγραφή, τον τύπο RNA και τους επιμελητές· διαβάστε την πλήρη εγγραφή μιας οικογένειας συμπεριλαμβανομένης της περιγραφής της, της ταξινόμησης τύπου RNA, των επιμελητών που την κατασκεύασαν, του αριθμού αλληλουχιών στις πλήρεις και σπορ στοιχίσεις, της πηγής δομής, του σχολίου του επιμελητή, της ομάδας (clan) στην οποία ανήκει και της έκδοσης Rfam· και περιηγηθείτε στις οικογένειες ανά κατηγορία RNA. Ιδανικό για βιολογία RNA, βιοπληροφορικές ροές εργασίας, σχολιασμό μη-κωδικοποιητικών RNA, συγκριτική γονιδιωματική και διδασκαλία. Τα αναγνωριστικά οικογενειών μοιάζουν με RF00005 (μεταφορικό RNA). Δεδομένα από το EMBL-EBI Rfam. Για οικογένειες και τομείς πρωτεϊνών δείτε το API InterPro, για πρωτεϊνικές αλληλουχίες το UniProt, για σύνολα δεδομένων πρωτεομικής το PRIDE και για μεταβολομική το MetaboLights.

#rfam #rna #non-coding-rna #riboswitch #ribozyme #bioinformatics #life-sciences
api.oanor.com/rfam-api
Λάβετε ένα κλειδί API Δοκιμάστε στην παιδική χαρά → Επικοινωνήστε με τον πάροχο

Προδιαγραφές αναγνώσιμες από μηχανή, ώστε οι πράκτορες AI να μπορούν να ενσωματώσουν αυτό το API.

/api/rfam-api/openapi.json
/api/rfam-api/llms.txt

Ανακάλυψη: Το GET /api/index.json παραθέτει κάθε API.

API Rfam — live data on the oanor API marketplace

Υγεία API

υγιής
Χρόνος λειτουργίας
100.00%
Ανιχνευτές διακομιστή · 24 ώρες
Μέση καθυστέρηση
339 ms
Ανιχνευτές διακομιστή · 24 ώρες
Συνδρομητές
4,715
ενεργός
Σύνολο κλήσεων
80
τις τελευταίες 7 ημέρες
status Πλήρης σελίδα κατάστασης → · 16 ανιχνευτές/24 ώρες

Τιμολόγηση

Επιλέξτε μια βαθμίδα — χρεώνεται μηνιαία, ακυρώστε ανά πάσα στιγμή.

Free

Δωρεάν

  • 560 κλήσεις / μήνα
  • 2 αιτήματα / δευτερόλεπτο
  • Hard cap (429 πάνω από το όριο, χωρίς υπέρβαση)
  • 560 κλήσεις/μήνα
  • 2 αιτήσεις/δευτ.
  • Αναζήτηση, οικογένεια & περιήγηση
  • Χωρίς πιστωτική κάρτα
Συνδεθείτε για να εγγραφείτε

Starter

€6.40 /μήνας

  • 20,000 κλήσεις / μήνα
  • 6 αιτήματα / δευτερόλεπτο
  • Hard cap (429 πάνω από το όριο, χωρίς υπέρβαση)
  • 20k κλήσεις/μήνα
  • 6 αιτήσεις/δευτ.
  • Πλήρη οικογενειακά αρχεία
  • Υποστήριξη μέσω email
Συνδεθείτε για να εγγραφείτε

Pro

€19.80 /μήνας

  • 91,000 κλήσεις / μήνα
  • 15 αιτήματα / δευτερόλεπτο
  • Hard cap (429 πάνω από το όριο, χωρίς υπέρβαση)
  • 91k κλήσεις/μήνα
  • 15 αιτήσεις/δευτ.
  • Αγωγοί σχολιασμού RNA
  • Υποστήριξη προτεραιότητας
Συνδεθείτε για να εγγραφείτε

Mega

€55.00 /μήνας

  • 378,000 κλήσεις / μήνα
  • 40 αιτήματα / δευτερόλεπτο
  • Hard cap (429 πάνω από το όριο, χωρίς υπέρβαση)
  • 378k κλήσεις/μήνα
  • 40 req/sec
  • Συγκριτική γονιδιωματική υψηλής απόδοσης
  • Αφιερωμένο SLA
Συνδεθείτε για να εγγραφείτε

Κατασκευάστηκε από

P
PremiumApi

Σχετικό API

Άλλο API με επικαλυπτόμενες ετικέτες.

API Αλληλουχίας DNA — oanor API marketplace

API Αλληλουχίας DNA

Μαθηματικά ανάλυσης αλληλουχίας DNA/RNA ως API, υπολογισμένα τοπικά και ντετερμινιστικά. Το τελικό σημείο analyze αναφέρει το μήκος και τη σύνθεση βάσεων μιας αλληλουχίας, την περιεκτικότητα GC και AT, το συμπλήρωμα, το αντίστροφο και το αντίστροφο συμπλήρωμα (το αντίθετο νήμα που διαβάζεται 5'→3'), και το κατά προσέγγιση μοριακό βάρος μονής αλυσίδας. Το τελικό σημείο translate μεταγράφει DNA σε mRNA (T→U) και το μεταφράζει σε πρωτεΐνη με τον τυπικό γενετικό κώδικα στο πλαίσιο ανάγνωσης 1, 2 ή 3, δίνοντας την αλληλουχία αμινοξέων με ένα γράμμα, το μήκος πρωτεΐνης και τον αριθμό των κωδικονίων λήξης. Το τελικό σημείο melting εκτιμά τη θερμοκρασία τήξης ενός εκκινητή με τον κανόνα Wallace, 4·(G+C) + 2·(A+T), για μικρά ολιγονουκλεοτίδια και έναν βασικό τύπο προσαρμοσμένο σε άλατα για μεγαλύτερα. Οι αλληλουχίες δεν κάνουν διάκριση πεζών-κεφαλαίων και κενών και δέχονται A, C, G, T για DNA ή U για RNA. Όλα υπολογίζονται τοπικά και ντετερμινιστικά, επομένως είναι άμεσα και ιδιωτικά. Ιδανικό για βιοπληροφορική, μοριακή βιολογία, γονιδιωματική και προγραμματιστές εργαστηριακών εφαρμογών, εργαλεία σχεδιασμού εκκινητών και επιθεώρησης αλληλουχιών, και εκπαίδευση βιολογίας. Καθαρός τοπικός υπολογισμός — χωρίς κλειδί, χωρίς υπηρεσία τρίτου μέρους, άμεσο. Ζωντανό, τίποτα δεν αποθηκεύεται. 3 τελικά σημεία. Αυτή είναι ανάλυση αλληλουχίας· για δεδομένα συναρμολόγησης γονιδιώματος χρησιμοποιήστε ένα API γονιδιωμάτων.

api.oanor.com/dna-api

 API Θερμοκρασίας Τήξης DNA — oanor API marketplace

API Θερμοκρασίας Τήξης DNA

Μαθηματικά DNA-ολιγονουκλεοτιδίων και PCR-εκκινητών ως API, υπολογιζόμενα τοπικά και ντετερμινιστικά. Το τελικό σημείο tm υπολογίζει τη θερμοκρασία τήξης μιας αλληλουχίας εκκινητή με τρεις τρόπους: τον κανόνα Wallace 2·(A+T) + 4·(G+C) για μικρά ολιγονουκλεοτίδια έως 13 νουκλεοτίδια, τον τύπο GC Marmur–Wallace 64.9 + 41·(nGC − 16.4)/N για μεγαλύτερα, και τον προσαρμοσμένο σε άλας 81.5 + 0.41·%GC − 675/N + 16.6·log10[Na+] για δεδομένη συγκέντρωση νατρίου, και προτείνει τη σωστή μέθοδο για το μήκος — ένα οκταμερές ATGCATGC τήκεται στους 24 °C κατά Wallace, ένας εκκινητής 20 βάσεων με 50 % GC στους περίπου 51.8 °C κατά Marmur. Το τελικό σημείο gc-content αναφέρει τα ποσοστά GC και AT, τις μετρήσεις ανά βάση και το μοριακό βάρος μονής αλυσίδας. Το τελικό σημείο reverse-complement επιστρέφει το συμπλήρωμα, την αντιστροφή και το αντίστροφο συμπλήρωμα μιας αλυσίδας. Οι αλληλουχίες χρησιμοποιούν A/C/G/T (χωρίς διάκριση πεζών-κεφαλαίων, τα κενά αγνοούνται) και [Na+] σε mol/L. Όλα υπολογίζονται τοπικά και ντετερμινιστικά, επομένως είναι άμεσα και ιδιωτικά. Ιδανικό για προγραμματιστές εφαρμογών μοριακής βιολογίας, βιοτεχνολογίας, PCR, σχεδιασμού εκκινητών, βιοπληροφορικής και εργαστηριακού αυτοματισμού, υπολογιστές ολιγονουκλεοτιδίων και εκκινητών, και λογισμικό LIMS. Τύποι εκτίμησης για σχεδιασμό εκκινητών, όχι υποκατάστατο της θερμοδυναμικής πλησιέστερου γείτονα. Καθαρός τοπικός υπολογισμός — χωρίς κλειδί, χωρίς υπηρεσία τρίτου, άμεσο. Ζωντανό, τίποτα δεν αποθηκεύεται. 3 τελικά σημεία. Αυτή είναι θερμοκρασία τήξης ολιγονουκλεοτιδίων· για συχνότητες αλληλόμορφων πληθυσμιακής γενετικής χρησιμοποιήστε ένα API γενετικής.

api.oanor.com/dnamelt-api

 API Συναρμολογήσεων Γονιδιώματος — oanor API marketplace

API Συναρμολογήσεων Γονιδιώματος

Συναρμολογήσεις γονιδιώματος αναφοράς ως API — με τη δύναμη του NCBI Assembly, του καταλόγου γονιδιωματικών κατασκευών για οργανισμούς σε όλο το δέντρο της ζωής. Αναζητήστε συναρμολογήσεις ανά οργανισμό (ή ελεύθερο κείμενο) και δείτε τα μεταδεδομένα οποιασδήποτε συναρμολόγησης: την πρόσβασή της (GCF_… RefSeq ή GCA_… GenBank), το όνομα (π.χ. GRCh38.p14), τον οργανισμό και το αναγνωριστικό taxon, το επίπεδο συναρμολόγησης (πλήρες γονιδίωμα, χρωμόσωμα, σκαλωσιά ή contig), στατιστικά συνέχειας (N50 contig και scaffold), κάλυψη αλληλούχισης, κατηγορία RefSeq, ονόματα UCSC και Ensembl, τον οργανισμό υποβολής, ημερομηνία κυκλοφορίας και διαδρομές λήψης FTP. Από το ανθρώπινο γονιδίωμα αναφοράς έως οποιονδήποτε αλληλουχημένο μικροοργανισμό, φυτό ή ζώο, μετατρέπει τον κατάλογο συναρμολογήσεων γονιδιώματος σε ένα καθαρό API αναζήτησης και λήψης. Ένας κατάλογος συναρμολογήσεων γονιδιώματος — διακριτός από βάσεις δεδομένων αλληλουχίας (ENA), γονιδιωματικής σχολιασμού (Ensembl), παραλλαγών (ClinVar, dbVar) και γονιδιακής έκφρασης (GEO). Ανοικτά δεδομένα από το NCBI Assembly (δημόσιος τομέας).

api.oanor.com/genomes-api

 API Γονιδιακής Έκφρασης — oanor API marketplace

API Γονιδιακής Έκφρασης

Πειράματα λειτουργικής γονιδιωματικής ως API — υποστηρίζεται από το NCBI GEO (Gene Expression Omnibus), το μεγαλύτερο δημόσιο αποθετήριο δεδομένων γονιδιακής έκφρασης. Το GEO αρχειοθετεί σειρές έκφρασης και επιμελημένα σύνολα δεδομένων από πειράματα μικροσυστοιχιών και αλληλούχησης υψηλής απόδοσης σε κάθε οργανισμό. Αναζητήστε πειράματα με λέξη-κλειδί και προαιρετικά με οργανισμό, και αναζητήστε οποιαδήποτε σειρά ή σύνολο δεδομένων για να λάβετε τα μεταδεδομένα του: τίτλο, περίληψη, τύπο ανάλυσης (προφίλ έκφρασης με μικροσυστοιχία ή με αλληλούχηση), οργανισμό, αριθμό δειγμάτων, πλατφόρμα και τη δημοσίευση που το υποστηρίζει. Από μελέτες στρες β-κυττάρων έως μεταγραφομική καρκίνου σε άνθρωπο και ποντίκι, μετατρέπει το αρχείο GEO σε ένα απλό API αναζήτησης και ανάκτησης για μεταγραφομική, βιοπληροφορική και ανακάλυψη ερευνητικών δεδομένων. Ένα αποθετήριο συνόλων δεδομένων γονιδιακής έκφρασης / λειτουργικής γονιδιωματικής — διακριτό από βάσεις δεδομένων αλληλουχίας (ENA), παραλλαγών (ClinVar, dbVar), δομής (PDB) και οντολογιών. Ανοικτά δεδομένα από το NCBI GEO (δημόσιος τομέας).

api.oanor.com/geodatasets-api

Συχνές ερωτήσεις

Γρήγορες απαντήσεις για τιμές, ποσοστώσεις και ενσωμάτωση.

Πώς αποκτώ ένα κλειδί API για το API Rfam;
Εγγράψου δωρεάν στο oanor.com, δημιούργησε ένα κλειδί API από τον πίνακα ελέγχου προγραμματιστή και κάλεσε το API Rfam με την κεφαλίδα x-oanor-key. Δεν απαιτείται πιστωτική κάρτα για το δωρεάν πλάνο.
Ποιο είναι το όριο ρυθμού του API Rfam;
Το δωρεάν πλάνο επιτρέπει 1 αίτημα ανά δευτερόλεπτο. Τα επί πληρωμή πλάνα κλιμακώνονται έως 50 αιτήματα ανά δευτερόλεπτο στο επίπεδο Mega. Τα αυστηρά όρια επιστρέφουν HTTP 429 πάνω από την ποσόστωση — χωρίς εκπλήξεις στις χρεώσεις υπερβάσεων.
Πόσο κοστίζει το API Rfam;
Το API Rfam έχει δωρεάν πλάνο με 100 κλήσεις / μήνα. Τα επί πληρωμή πλάνα ξεκινούν από €6.40 / μήνα με υψηλότερες ποσοστώσεις και ταχύτερα όρια ρυθμού.
Μπορώ να ακυρώσω τη συνδρομή μου ανά πάσα στιγμή;
Ναι. Τα πλάνα χρεώνονται μηνιαίως και μπορείς να ακυρώσεις οποτεδήποτε από το ταμπλό χρέωσης. Χωρίς μακροπρόθεσμα συμβόλαια και χωρίς τέλος ακύρωσης.
Είναι το API Rfam συμβατό με τον GDPR;
Όλα τα αιτήματα προς API Rfam περνούν μέσω της πύλης μας στην ΕΕ. Το upstream API κλειδί σου δεν φεύγει ποτέ από τον διακομιστή μας και δεν μοιράζονται προσωπικά δεδομένα με τον upstream πάροχο πέρα από το αίτημα που στέλνεις.

Επιλέξτε ένα τελικό σημείο από τη λίστα στα αριστερά για να δείτε τις λεπτομέρειες και δοκιμάστε το.

Αποσπάσματα κώδικα

Εγγραφείτε για να λάβετε ένα API key και, στη συνέχεια, καλέστε οποιαδήποτε διαδρομή κάτω από το slug σας.

curl https://api.oanor.com/rfam-api/SOME_PATH \
  -H "x-oanor-key: oanor_test_..."
const res = await fetch("https://api.oanor.com/rfam-api/SOME_PATH", {
  headers: { "x-oanor-key": "oanor_test_..." }
});
const data = await res.json();
$ch = curl_init("https://api.oanor.com/rfam-api/SOME_PATH");
curl_setopt($ch, CURLOPT_RETURNTRANSFER, true);
curl_setopt($ch, CURLOPT_HTTPHEADER, ["x-oanor-key: oanor_test_..."]);
$response = curl_exec($ch);
import requests
r = requests.get(
    "https://api.oanor.com/rfam-api/SOME_PATH",
    headers={"x-oanor-key": "oanor_test_..."},
)
print(r.json())

Αξιολογήσεις

Συνδεθείτε για να βαθμολογήσετε.

Δεν υπάρχουν ακόμη κριτικές.

Συζήτηση

Κάνε ερωτήσεις, μοιράσου συμβουλές, πάρε απαντήσεις από τον πάροχο και άλλους προγραμματιστές. Δημόσιο — όλοι μπορούν να διαβάσουν.

Συνδέσου για να γράψεις ή να απαντήσεις.

Σύνδεση

Νέα συζήτηση

/ 4000

📌 Καρφιτσωμένη 🔒 Κλειδωμένη

·

· ·

/ 4000

🔒 Η συζήτηση είναι κλειδωμένη — δεν επιτρέπονται νέες απαντήσεις.

  • Δεν υπάρχουν συζητήσεις — ξεκίνα την πρώτη.

Υποστήριξη

Ιδιωτική υποστήριξη 1:1 με τον πάροχο — χρέωση, ενσωμάτωση, λογαριασμός. Μόνο εσύ και η ομάδα του παρόχου βλέπετε αυτά τα threads.

Συνδέσου για να ανοίξεις ticket υποστήριξης.

Σύνδεση

Άνοιγμα νέου ticket

Περιέγραψε με τι χρειάζεσαι βοήθεια. Η ομάδα λαμβάνει email και απαντά στη σελίδα του ticket.

  • Δεν υπάρχουν tickets για αυτό το API.

Η συνδρομή είναι ενεργή — οι κλήσεις μπορούν να ξεκινήσουν αμέσως.

Στείλτε το πρώτο σας αίτημα —

Η συνδρομή είναι ενεργή — αντιγράψτε ένα απόσπασμα και ενεργοποιήστε την πρώτη σας κλήση.