#rna

Matemática de análise de sequências de DNA/RNA como uma API, computada local e deterministicamente. O endpoint analyze relata o comprimento e a composição de bases de uma sequência, o conteúdo GC e AT, o complemento, o reverso e o complemento reverso (a fita oposta lida 5'→3'), e o peso molecular aproximado de fita simples. O endpoint translate transcreve DNA para mRNA (T→U) e o traduz para proteína com o código genético padrão no quadro de leitura 1, 2 ou 3, fornecendo a sequência de aminoácidos em código de uma letra, o comprimento da proteína e o número de códons de parada. O endpoint melting estima a temperatura de melting de um primer com a regra de Wallace, 4·(G+C) + 2·(A+T), para oligonucleotídeos curtos e uma fórmula básica ajustada por sal para os mais longos. As sequências são insensíveis a maiúsculas/minúsculas e espaços em branco e aceitam A, C, G, T para DNA ou U para RNA. Tudo é computado local e deterministicamente, portanto é instantâneo e privado. Ideal para bioinformática, biologia molecular, genômica e desenvolvedores de aplicativos de laboratório, ferramentas de design de primers e inspeção de sequências, e educação em biologia. Computação puramente local — sem chave, sem serviço de terceiros, instantâneo. Ao vivo, nada armazenado. 3 endpoints. Esta é análise de sequência; para dados de montagem de genoma, use uma API de genomas.

api.oanor.com/dna-api

La base de datos Rfam de familias de ARN no codificante como API, impulsada por EMBL-EBI. Rfam agrupa ARN funcionales que comparten un origen evolutivo común en familias, cada una modelada por un modelo de covarianza construido a partir de una alineación semilla curada y una estructura secundaria. Busque las familias por nombre, descripción o tipo de ARN — riboswitches y otros elementos reguladores cis, ribozimas, familias de microARN, ARN ribosómicos, ARN de transferencia, ARN nucleares pequeños y ARN nucleolares pequeños, ARN largos no codificantes y repeticiones directas CRISPR — obteniendo el acceso Rfam de cada familia, nombre, descripción, tipo de ARN y curadores; lea el registro completo de una familia, incluyendo su descripción, clasificación por tipo de ARN, los curadores que la construyeron, el número de secuencias en sus alineaciones completas y semilla, la fuente de la estructura, el comentario del curador, el clan (grupo de familias relacionadas) al que pertenece y la versión de Rfam; y navegue por las familias según la clase de ARN. Ideal para biología del ARN, pipelines bioinformáticos, anotación de ARN no codificante, genómica comparativa y enseñanza. Los accesos de las familias se ven como RF00005 (ARN de transferencia). Datos de EMBL-EBI Rfam. Para familias y dominios de proteínas, consulte la API InterPro; para secuencias de proteínas, UniProt; para conjuntos de datos de proteómica, PRIDE; y para metabolómica, MetaboLights.

api.oanor.com/rfam-api