#rna

Mathématiques d'analyse de séquences ADN/ARN sous forme d'API, calculées localement et de manière déterministe. Le point de terminaison analyze rapporte la longueur et la composition en bases d'une séquence, le contenu GC et AT, le complément, l'inverse et le complément inverse (le brin opposé lu 5'→3'), et le poids moléculaire approximatif simple brin. Le point de terminaison translate transcrit l'ADN en ARNm (T→U) et le traduit en protéine avec le code génétique standard dans le cadre de lecture 1, 2 ou 3, donnant la séquence d'acides aminés en une lettre, la longueur de la protéine et le nombre de codons stop. Le point de terminaison melting estime la température de fusion d'une amorce avec la règle de Wallace, 4·(G+C) + 2·(A+T), pour les oligos courts et une formule de base ajustée au sel pour les plus longs. Les séquences sont insensibles à la casse et aux espaces et acceptent A, C, G, T pour l'ADN ou U pour l'ARN. Tout est calculé localement et de manière déterministe, donc instantané et privé. Idéal pour la bioinformatique, la biologie moléculaire, la génomique et les développeurs d'applications de laboratoire, les outils de conception d'amorces et d'inspection de séquences, et l'enseignement de la biologie. Calcul local pur — pas de clé, pas de service tiers, instantané. En direct, rien n'est stocké. 3 points de terminaison. Ceci est une analyse de séquence ; pour les données d'assemblage de génome, utilisez une API génomes.

api.oanor.com/dna-api

La base de données Rfam des familles d'ARN non codants sous forme d'API, propulsée par EMBL-EBI. Rfam regroupe les ARN fonctionnels partageant une origine évolutive commune en familles, chacune modélisée par un modèle de covariance construit à partir d'un alignement de référence et d'une structure secondaire. Recherchez les familles par nom, description ou type d'ARN — riboswitches et autres éléments cis-régulateurs, ribozymes, familles de microARN, ARN ribosomiques, ARN de transfert, petits ARN nucléaires et petits ARN nucléolaires, longs ARN non codants et répétitions CRISPR — en obtenant l'accession Rfam, le nom, la description, le type d'ARN et les conservateurs de chaque famille ; lisez l'enregistrement complet d'une famille, y compris sa description, sa classification par type d'ARN, les conservateurs qui l'ont construite, le nombre de séquences dans ses alignements complets et de référence, la source de la structure, le commentaire du conservateur, le clan (groupe de familles apparentées) auquel elle appartient et la version de Rfam ; et parcourez les familles par classe d'ARN. Idéal pour la biologie de l'ARN, les pipelines bioinformatiques, l'annotation des ARN non codants, la génomique comparative et l'enseignement. Les accessions de famille ressemblent à RF00005 (ARN de transfert). Données provenant d'EMBL-EBI Rfam. Pour les familles et domaines de protéines, voir l'API InterPro, pour les séquences protéiques UniProt, pour les ensembles de données protéomiques PRIDE et pour la métabolomique MetaboLights.

api.oanor.com/rfam-api