Marché API

L'European Nucleotide Archive (ENA) en tant qu'API, propulsé par EMBL-EBI — l'un des trois partenaires INSDC aux côtés de NCBI GenBank et DDBJ, et l'archive publique complète des données de séquences nucléotidiques mondiales. ENA contient des lectures de séquençage brutes, des génomes assemblés et annotés, des séquences individuelles, des échantillons biologiques et les études qui les sous-tendent, pour chaque domaine du vivant — la ressource fondamentale pour la génomique, la microbiologie, l'écologie, l'évolution et la recherche clinique. Cette API offre un flux de travail propre en trois étapes sur cette archive. D'abord, /v1/taxon résout un nom d'organisme (par exemple "Homo sapiens") en son identifiant taxonomique NCBI, nom scientifique, rang taxonomique et lignée complète — ou recherche un taxon directement par son identifiant. Ensuite, /v1/search interroge l'archive pour les enregistrements de ce taxon d'un type choisi : assemblages de génomes (avec nom d'assemblage, niveau et nombre de bases), runs de séquençage (avec plateforme, instrument et nombres de lectures), échantillons biologiques (avec date de collecte et pays), séquences annotées, expériences de lecture, analyses, séquences codantes et non codantes, et études — par défaut incluant tous les taxons descendants, ou restreint au taxon exact. Enfin, /v1/record retourne un résumé pour tout accession ENA — assemblages (GCA_…), études et projets (PRJ…), échantillons (SAM…/ERS…), runs de séquençage (ERR…/SRR…) et séquences — avec son titre, type de données, taxon, nom scientifique, nombre de bases et de séquences, et statut public. Idéal pour les pipelines bioinformatiques, la découverte de données génomiques, la récolte de métadonnées de séquençage, les outils de biodiversité et de métagénomique, et la reproductibilité de la recherche. Les identifiants de taxon ressemblent à 9606 (humain) ; les accessions comme GCA_000001405. Données provenant d'EMBL-EBI ENA, une archive INSDC, libre d'utilisation.

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4,897

Données officielles américaines sur l'économie de carburant des véhicules sous forme d'API, propulsées par FuelEconomy.gov — la ressource conjointe de l'EPA américaine et du Département de l'Énergie derrière l'étiquette d'économie de carburant sur chaque voiture, VUS et camion vendu aux États-Unis depuis 1984. Parcourez le catalogue étape par étape — années modèles, puis marques, puis modèles, puis les versions moteur/transmission (chacune portant l'identifiant de véhicule nécessaire pour l'appel détaillé) — et extrayez le dossier complet d'économie de carburant d'un véhicule : MPG en ville, sur autoroute et combiné, type de carburant, moteur (nombre de cylindres et cylindrée), transmission, classe EPA du véhicule et transmission, le coût annuel estimé du carburant, les émissions de CO2 à l'échappement en grammes par mile, les barils de pétrole consommés par an et l'économie (ou le surcoût) estimée sur cinq ans par rapport à un véhicule neuf moyen. Idéal pour les outils d'achat et de comparaison de voitures, les calculateurs de coût total de possession et d'émissions, la gestion de flotte et les rapports de durabilité. Les données sont des données de test officielles et faisant autorité de l'EPA/DOE et sont dans le domaine public ; elles couvrent les véhicules légers du marché américain. Les identifiants de véhicule proviennent du point de terminaison des versions, accessible via la chaîne année -> marque -> modèle -> version.

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3,948

Horaires des transports publics suisses sous forme d'API, propulsée par le service officiel suisse de transport ouvert (transport.opendata.ch, basé sur l'horaire search.ch). L'un des réseaux de transport les plus denses et les plus ponctuels au monde — trains (SBB/CFF/FFS), trams, bus urbains et postaux, bateaux, funiculaires et téléphériques — dans une seule API propre. Trouvez des arrêts, des gares et des adresses par leur nom avec leur identifiant et leurs coordonnées ; planifiez un trajet complet porte-à-porte entre deux endroits quelconques avec un arrêt intermédiaire facultatif, une date et une heure, et la possibilité de rechercher par heure d'arrivée, obtenant pour chaque correspondance les heures de départ et d'arrivée et les quais, la durée totale en minutes, le nombre de correspondances, les produits de transport utilisés (par exemple IC 8 ou S 8) et la répartition complète étape par étape, y compris les sections à pied ; et lisez le tableau de départ ou d'arrivée en direct d'une gare avec la ligne, la destination, l'heure, le quai et tout retard en temps réel. Idéal pour les applications de planification de voyage et de mobilité, les outils de voyage, la logistique et le tourisme en Suisse. Les noms de lieux acceptent les noms d'arrêts ou les identifiants de gare du point de terminaison des lieux, et les heures incluent les retards en direct lorsqu'ils sont disponibles. Données provenant de transport.opendata.ch (données de transport ouvert suisses) ; couvre la Suisse et les connexions transfrontalières immédiates.

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4,141

MGnify en tant qu'API, propulsé par EMBL-EBI — la plus grande ressource gratuite au monde pour l'analyse et l'archivage des données de séquençage du microbiome, et la sœur métagénomique de PRIDE (protéomique) et MetaboLights (métabolomique). MGnify contient des dizaines de milliers d'études publiques de métagénomique et de métabarcodage couvrant le microbiome intestinal humain, les environnements marins et d'eau douce, les sols, les eaux usées, l'environnement bâti et les communautés associées à l'hôte. Recherchez les études par mot-clé, obtenant pour chaque étude son accession MGnify (MGYS...), son nom, son résumé, son biome, le nombre d'échantillons et le BioProject de séquençage source ; lisez les métadonnées complètes d'une étude, y compris son nom et son résumé, la classification du biome, le nombre d'échantillons, le centre de soumission, le statut public, l'origine des données et la date de dernière mise à jour ; et parcourez l'arbre de classification des biomes de style GOLD — de racine:Associé à l'hôte:Humain:Système digestif à racine:Environnemental:Aquatique:Marin — avec des comptes d'échantillons et d'études par biome, pour la découverte par environnement. Idéal pour la recherche sur le microbiome et la génomique environnementale, la réutilisation des ensembles de données et la méta-analyse, les pipelines bioinformatiques et l'enseignement. Les accessions d'étude ressemblent à MGYS00006862. Données provenant d'EMBL-EBI MGnify.

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3,355

Cellosaurus en tant qu'API, propulsé par l'Institut Suisse de Bioinformatique SIB — l'encyclopédie de référence des lignées cellulaires utilisées dans la recherche biomédicale. Avec plus de 150 000 entrées couvrant les lignées de cellules cancéreuses, les hybridomes, les cellules souches pluripotentes induites et les lignées de centaines d'espèces, Cellosaurus est le catalogue faisant autorité que les chercheurs utilisent pour identifier et valider les lignées cellulaires derrière les expériences publiées. Recherchez les lignées cellulaires par nom ou mot-clé, obtenant pour chaque lignée son accession Cellosaurus (CVCL_…), son nom, sa catégorie, son espèce et sa maladie ; et lisez l'enregistrement complet d'une lignée cellulaire — son nom et ses synonymes, sa catégorie (par exemple, lignée de cellules cancéreuses, hybridome, cellule souche), son espèce avec l'identifiant taxonomique NCBI, le sexe, l'âge, la maladie dont elle dérive avec les identifiants d'ontologie NCIt, le tissu ou site anatomique d'origine, sa lignée parentale et le nombre de lignées filles dérivées, le nombre de références bibliographiques et les nombreuses références croisées (vers ATCC, DSMZ, ECACC, Wikidata et plus), les pages web pertinentes, et — de manière critique pour la reproductibilité de la recherche — si la lignée est signalée comme PROBLÉMATIQUE, ce qui signifie qu'elle a été mal identifiée ou contaminée de manière croisée, avec les notes explicatives. Idéal pour le contrôle qualité en laboratoire et l'authentification des lignées cellulaires, la recherche biomédicale et sur le cancer, la curation des données et les vérifications de reproductibilité. Les accessions ressemblent à CVCL_0030 (HeLa). Données de Cellosaurus (CC-BY 4.0).

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4,669

La base de données de structures protéiques AlphaFold sous forme d'API, propulsée par EMBL-EBI et Google DeepMind. AlphaFold prédit la structure tridimensionnelle d'une protéine à partir de sa séquence d'acides aminés avec une précision de niveau expérimental, et la base de données couvre désormais plus de 200 millions de protéines — presque toutes les séquences d'UniProt. Recherchez le modèle AlphaFold pour n'importe quelle protéine par son accession UniProt et obtenez sa description de gène et de protéine, son organisme et sa longueur de séquence, la version du modèle et sa date de création, la métrique de confiance globale, la séquence complète d'acides aminés, et des liens de téléchargement directs vers la structure prédite au format mmCIF, PDB et BinaryCIF ainsi que l'image et les données du tracé de l'erreur alignée prédite (PAE) ; et lisez la couverture structurale d'une protéine — le(s) modèle(s) prédit(s) par AlphaFold et toute structure liée avec leur fournisseur, catégorie de modèle, méthode et la plage de résidus UniProt couverte. Idéal pour la biologie structurale, la découverte de médicaments et l'évaluation de cibles, l'ingénierie des protéines, la visualisation moléculaire et l'enseignement. Les protéines sont identifiées par l'accession UniProt (par exemple P00520 ou P38398). Données provenant de la base de données AlphaFold (CC-BY 4.0). Pour les structures 3D déterminées expérimentalement, voir l'API PDB, pour les séquences protéiques et l'annotation fonctionnelle, l'API UniProt, et pour les familles et domaines, InterPro.

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3,074

Le Parlement européen sous forme d'API, alimenté par le portail officiel de données ouvertes du Parlement européen (data.europarl.europa.eu). Suivez l'assemblée législative directement élue de l'UE : listez les députés au Parlement européen (députés) pour toute législature — la législature 10 est l'actuel Parlement 2024-2029 — avec pagination ; consultez le profil d'un député individuel, y compris son nom complet, son pays de représentation, son genre, son adresse e-mail de contact, sa photo officielle et son lieu de naissance, ainsi que ses appartenances aux commissions, groupes politiques et délégations, divisées en actuelles et passées, chacune avec le rôle occupé (membre, président, vice-président, …) et les dates de début et de fin ; et parcourez les organes du Parlement — ses commissions permanentes et spéciales (telles que ECON, ENVI, LIBE), groupes politiques et délégations interparlementaires — avec leur identifiant, acronyme, libellé et type. L'identifiant d'organisation qui apparaît dans les appartenances d'un député correspond à un organe, vous pouvez donc déterminer exactement à quelle commission ou groupe un membre siège. Idéal pour les outils de civic-tech et de transparence, la recherche politique et le journalisme, le suivi du lobbying et des affaires publiques, et l'analyse des politiques de l'UE. Les identifiants des députés proviennent du point de terminaison des députés. Données du Parlement européen (CC-BY 4.0).

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4,984

Le Complex Portal en tant qu'API, propulsé par EMBL-EBI — une base de données encyclopédique et organisée manuellement de complexes macromoléculaires stables : assemblages de deux protéines ou plus (et parfois d'acides nucléiques, de ligands ou de petites molécules) qui fonctionnent ensemble comme une unité fonctionnelle unique, tels que les ribosomes, les protéasomes, les ARN et ADN polymérases, le spliceosome, les complexes de la chaîne respiratoire et des milliers d'autres à travers de nombreuses espèces. Recherchez les complexes par mot-clé et éventuellement par organisme, obtenant pour chaque complexe son accession Complex Portal (CPX-…), son nom, son organisme, sa description et s'il est prédit par calcul ; lisez l'enregistrement complet d'un complexe, y compris ses noms recommandés et systématiques, synonymes, espèces, fonction biologique, les sous-unités participantes avec chacune son identifiant de molécule (par exemple une accession UniProt) et sa stœchiométrie, les ligands et maladies associés, le type de preuve et les références croisées vers UniProt, Gene Ontology, Reactome, Wikidata et plus encore ; et extrayez simplement la composition en sous-unités d'un complexe. Idéal pour la biologie structurale et des systèmes, l'analyse des voies et des réseaux, la recherche sur la fonction des protéines et les pipelines bioinformatiques. Les accessions de complexes ressemblent à CPX-6036. Données du Complex Portal d'EMBL-EBI (consortium IMEx, CC-BY). Pour les réseaux d'interactions protéine-protéine, voir l'API STRING, pour les séquences protéiques UniProt, pour les voies biologiques Reactome et pour les familles et domaines InterPro.

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3,747

Intelligence de routage Internet et de ressources numériques sous forme d'API, propulsée par RIPEstat — le service de données ouvertes du RIPE NCC, l'un des cinq registres Internet régionaux mondiaux. Répondez aux questions des ingénieurs réseau, des équipes de sécurité et des chercheurs sur l'Internet public : à quel système autonome et préfixe appartient une adresse IP ; qu'est-ce qu'un AS (son nom d'opérateur/détenteur, s'il est actuellement annoncé en BGP, son type et son bloc d'enregistrement) ; quels préfixes IPv4 et IPv6 un AS annonce-t-il ; qui sont les voisins et pairs BGP d'un AS (et combien) ; qui est le contact de signalement d'abus pour une IP, un préfixe ou un ASN, et quel RIR est compétent ; et un préfixe est-il correctement originaire selon la validation d'origine de route RPKI (valide, invalide ou inconnu) avec les ROA correspondants. Les données sont en temps réel, issues du réseau mondial de collecteurs de routes BGP du RIPE NCC et des registres. Les entrées acceptent les adresses IPv4 et IPv6, les préfixes CIDR et les numéros AS (avec ou sans le préfixe AS). Idéal pour les opérations réseau, le renseignement sur les menaces et la gestion des abus, la surveillance BGP et RPKI, la réputation IP et les outils OSINT, ainsi que la recherche Internet. Données provenant du service RIPEstat du RIPE NCC.

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4,133

Limites administratives ouvertes sous forme d'API, propulsées par geoBoundaries — la base de données ouverte des limites administratives politiques construite par le William & Mary geoLab. Pour plus de 200 pays et chaque niveau administratif — ADM0 (national), ADM1 (États, provinces ou régions), ADM2 (comtés ou districts) et jusqu'aux unités locales ADM4/ADM5 — obtenez les métadonnées de la limite (nom officiel, agence source qui l'a produite, licence des données, année représentée, nombre d'unités administratives et nombre moyen de sommets) ainsi que des liens de téléchargement directs vers la géométrie en GeoJSON pleine résolution, un GeoJSON simplifié, TopoJSON et un bundle ZIP ; listez chaque niveau administratif disponible pour un pays avec son nombre d'unités et son lien de téléchargement ; et parcourez le catalogue complet des pays qui ont des limites. La géométrie elle-même est livrée sous forme de fichiers GeoJSON/TopoJSON standard aux URL renvoyées, prête à être intégrée dans Leaflet, Mapbox, QGIS, deck.gl ou toute pipeline SIG. Idéal pour la cartographie et la visualisation, les choroplèthes, les jointures spatiales, le géorepérage, la cartographie électorale et de recensement et l'analyse de localisation. Les codes ISO sont à 3 lettres (DEU, USA, BRA) ; les niveaux administratifs vont de ADM0 à ADM5. Données du projet geoBoundaries (CC-BY 4.0).

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3,934

Les Objectifs de développement durable des Nations Unies sous forme d'API, alimentés par l'API officielle des ODD de la Division de statistique des Nations Unies. Les ODD sont le plan commun mondial — 17 objectifs, 169 cibles et plus de 200 indicateurs — pour éliminer la pauvreté et la faim, assurer la bonne santé et une éducation de qualité, parvenir à l'égalité des genres, fournir de l'eau potable et une énergie abordable, promouvoir un travail décent et une croissance économique, construire des villes durables, agir pour le climat et protéger la vie terrestre et aquatique, le tout d'ici 2030. Parcourez les 17 objectifs avec leurs titres complets et descriptions ; ouvrez n'importe quel objectif pour voir chaque cible et les indicateurs qui la mesurent ; listez les séries de données statistiques derrière un indicateur (avec leurs codes machine et descriptions) ; extrayez la série chronologique complète d'une série pour n'importe quel pays — chaque point de données avec son année, sa valeur, son unité, ses dimensions de ventilation (sexe, âge, lieu, …) et sa source ; et recherchez les pays, régions et le monde avec leurs codes de zone numérique UN M49. Idéal pour la recherche sur le développement, les tableaux de bord des ONG et des politiques, le journalisme, les rapports ESG et de durabilité, et l'éducation. Les codes d'indicateur proviennent du point de terminaison des objectifs, les codes de série du point de terminaison des séries, et les codes de zone du point de terminaison des zones (276 = Allemagne, 826 = Royaume-Uni, 1 = Monde). Données provenant de la base de données mondiale des indicateurs des ODD de la Division de statistique des Nations Unies.

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3,049

La base de données Rfam des familles d'ARN non codants sous forme d'API, propulsée par EMBL-EBI. Rfam regroupe les ARN fonctionnels partageant une origine évolutive commune en familles, chacune modélisée par un modèle de covariance construit à partir d'un alignement de référence et d'une structure secondaire. Recherchez les familles par nom, description ou type d'ARN — riboswitches et autres éléments cis-régulateurs, ribozymes, familles de microARN, ARN ribosomiques, ARN de transfert, petits ARN nucléaires et petits ARN nucléolaires, longs ARN non codants et répétitions CRISPR — en obtenant l'accession Rfam, le nom, la description, le type d'ARN et les conservateurs de chaque famille ; lisez l'enregistrement complet d'une famille, y compris sa description, sa classification par type d'ARN, les conservateurs qui l'ont construite, le nombre de séquences dans ses alignements complets et de référence, la source de la structure, le commentaire du conservateur, le clan (groupe de familles apparentées) auquel elle appartient et la version de Rfam ; et parcourez les familles par classe d'ARN. Idéal pour la biologie de l'ARN, les pipelines bioinformatiques, l'annotation des ARN non codants, la génomique comparative et l'enseignement. Les accessions de famille ressemblent à RF00005 (ARN de transfert). Données provenant d'EMBL-EBI Rfam. Pour les familles et domaines de protéines, voir l'API InterPro, pour les séquences protéiques UniProt, pour les ensembles de données protéomiques PRIDE et pour la métabolomique MetaboLights.

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4,715

L'Observatoire mondial de la santé (GHO) de l'Organisation mondiale de la Santé sous forme d'API — des statistiques sanitaires mondiales faisant autorité pour chaque État membre de l'OMS. Recherchez un catalogue de plus de 3 000 indicateurs de santé couvrant l'espérance de vie et l'espérance de vie en bonne santé, la mortalité et les causes de décès, la vaccination et la couverture vaccinale, la charge de morbidité des maladies transmissibles et non transmissibles, la santé maternelle et infantile, la nutrition, la santé mentale, le personnel de santé, le financement de la santé, l'eau et l'assainissement, et les facteurs de risque tels que le tabac, l'alcool et l'obésité. Pour tout indicateur, extrayez la série chronologique complète d'un pays — chaque point de données avec son année, sa valeur, l'intervalle d'incertitude de l'OMS (limites inférieure et supérieure), la région OMS et la dimension de ventilation (par exemple le sexe) — ou comparez l'indicateur entre plusieurs pays pour une année choisie, ou la dernière année disponible par pays, classée par valeur. Les codes pays sont ISO3 (DEU, USA, JPN) ou les codes région OMS ; les résultats peuvent être filtrés par sexe (les deux, masculin ou féminin). Idéal pour la recherche en santé publique, le journalisme, les tableaux de bord des ONG et des politiques, l'épidémiologie et l'analyse du développement mondial. Les codes indicateurs proviennent du endpoint des indicateurs (par exemple WHOSIS_000001 est l'espérance de vie à la naissance). Données provenant de l'Observatoire mondial de la santé de l'OMS.

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4,427

Intelligence sur la chaîne d'approvisionnement logicielle et les dépendances sous forme d'API, propulsée par deps.dev — le service Open Source Insights de Google. Sur six écosystèmes de packages (npm, PyPI, Maven, Cargo, Go et NuGet), il répond aux questions qu'un registre ne peut pas : qu'est-ce que l'installation de ce package implique réellement, et quelle est la santé du projet derrière ? Listez les versions publiées d'un package et sa version par défaut ; lisez les licences déclarées d'une version spécifique, les clés de tout avis de sécurité connu, les liens utiles (dépôt source, page d'accueil, suivi de problèmes) et les projets connexes ; résolvez le graphe de dépendances TRANSITIF complet d'une version — le nombre total de dépendances, les dépendances directes et chaque nœud transitif avec sa version résolue exacte et s'il s'agit d'une dépendance directe ou indirecte ; et consultez le Scorecard OpenSSF d'un projet source — le score de sécurité global ainsi que les résultats par vérification pour Maintenu, Révision de code, Protection de branche, Workflow dangereux, Vulnérabilités et plus encore — accompagné de ses étoiles, forks, problèmes ouverts, licence et page d'accueil. Pour les modules Go et les artefacts Maven, le nom du package est le chemin complet du module ou groupe:artefact (encodé URL automatiquement). Idéal pour l'audit de dépendances, l'enrichissement de logiciels-bill-of-materials (SBOM), l'évaluation des risques de la chaîne d'approvisionnement et les outils de conformité des licences. Données provenant de deps.dev (Google, CC-BY).

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4,367

Dates de fin de vie et de cycle de support des produits sous forme d'API, propulsé par endoflife.date — la référence maintenue par la communauté pour savoir quand un logiciel cesse d'être supporté. Couvre plus de 450 produits à travers toutes les couches de la pile : distributions Linux (Ubuntu, Debian, RHEL, Alpine…), langages de programmation (PHP, Python, Node.js, Java, Go, Ruby…), frameworks (Django, Laravel, Spring Boot, React, Angular…), bases de données (PostgreSQL, MySQL, MongoDB, Redis…), systèmes d'exploitation, navigateurs, appareils matériels et plus encore. Listez chaque produit suivi ; pour tout produit, obtenez tous ses cycles de publication avec la date de sortie, la dernière version de correctif et sa date de sortie, le drapeau LTS, la date de fin de support actif et la date de fin de vie ; et consultez un seul cycle de publication individuellement. Chaque cycle est enrichi d'un statut calculé en direct par rapport à la date du jour — si la version est toujours supportée, si elle a déjà atteint sa fin de vie, combien de jours restent avant la fin de vie et si le support actif a pris fin — afin que vous puissiez répondre à « cette version est-elle toujours supportée ? » et « combien de temps avant de devoir mettre à niveau ? » en un seul appel. Idéal pour l'audit des dépendances, la planification des mises à niveau et des migrations, les tableaux de bord de sécurité et de conformité, les vérifications CI et les inventaires de plateformes. Les slugs de produits proviennent du point de terminaison des produits (par exemple php, ubuntu, nodejs, postgresql). Le statut calculé est relatif à la date UTC actuelle. Données provenant de endoflife.date (CC-BY-SA).

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3,998

Le portail des données ouvertes de l'Union européenne sous forme d'API, alimenté par data.europa.eu — le point d'accès unique officiel à plus de 1,8 million d'ensembles de données ouvertes publiés par les institutions de l'UE et récoltés depuis les portails nationaux de données ouvertes des 27 États membres (y compris data.gov.uk, data.gouv.fr et GovData Germany). Recherchez des ensembles de données dans tous les thèmes — énergie, santé, transport, environnement, agriculture, économie, justice et plus — avec des filtres optionnels par format de fichier et par pays de publication, obtenant pour chaque ensemble son identifiant, son titre et sa description en anglais, son éditeur, son portail source, son pays, les formats disponibles, le nombre de ressources, la date de dernière modification et la licence ; lisez les métadonnées complètes d'un ensemble ainsi que toutes ses distributions téléchargeables (titre, format et URL directe de chaque distribution), ainsi que les catégories, mots-clés, langues et couverture temporelle ; et explorez les facettes de découverte pour toute requête — les formats de fichier les plus courants et les pays publiant des ensembles correspondants. Idéal pour le journalisme de données, les applications civic-tech et govtech, la recherche, l'analyse de marché et de politique, et tout outil ayant besoin de trouver et télécharger des informations du secteur public européen. Les identifiants des ensembles proviennent des résultats de recherche ; les titres et descriptions sont renvoyés en anglais lorsqu'ils sont disponibles. Données provenant de data.europa.eu (licences variables selon l'ensemble ; la plupart sont CC-BY ou domaine public).

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3,035

Le Répertoire des revues en libre accès sous forme d'API, propulsé par DOAJ — l'index faisant autorité et organisé par la communauté de la recherche en libre accès évaluée, couvrant plus de 20 000 revues contrôlées et plus de 10 millions d'articles dans toutes les disciplines. Recherchez des revues en libre accès avec la syntaxe complète des requêtes Elasticsearch, obtenant pour chaque revue son titre, ses ISSN, son éditeur et son pays, ses sujets, ses langues, si des frais de traitement d'article (APC) s'appliquent, sa licence et l'année où elle est devenue libre accès ; lisez l'enregistrement complet d'une revue, y compris ses sujets avec le schéma de classification, les mots-clés, les licences, les prix APC, la politique de dispense de frais, le processus d'évaluation par les pairs, la détection du plagiat, la conservation à long terme et les politiques d'auto-archivage (dépôt) et la page d'accueil ; recherchez des articles en libre accès retournant le titre, les auteurs, la revue, l'année, le DOI, les mots-clés et un lien vers le texte intégral gratuit ; et lisez les métadonnées complètes d'un article avec son résumé, ses auteurs et affiliations, la revue et les ISSN, les pages, les sujets et les liens directs vers le texte intégral librement accessible. Idéal pour les outils de science ouverte, les systèmes de bibliothèque et de dépôt, la découverte de recherche, l'analyse des APC et des politiques, et toute application nécessitant des recherches évaluées par les pairs légalement gratuites. Identifiez une revue par son ISSN et un article par son DOI ou son identifiant DOAJ à partir des résultats de recherche. Données de DOAJ.

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3,308

ORCID en tant qu'API — le registre mondial des identités de chercheurs, alimenté par l'API publique ORCID. Un iD ORCID (par exemple 0000-0002-1825-0097) identifie de manière unique et persistante un chercheur à travers les revues, les bailleurs de fonds, les universités et l'ensemble du dossier académique. Recherchez plus de 15 millions de chercheurs par nom, institution, mot-clé ou identifiant externe en utilisant la syntaxe riche des champs Solr, obtenant pour chaque correspondance l'iD ORCID, le nom, les autres noms et les institutions affiliées ; lisez le profil public d'un chercheur, y compris ses noms publiés et de crédit, sa biographie, ses mots-clés de recherche, son pays, ses sites web personnels et de laboratoire, et les identifiants externes tels que Scopus Author ID ou ResearcherID ; listez les travaux qu'il a revendiqués dans son dossier avec le titre, le type, l'année de publication, la revue et le DOI de chaque travail ; et retracez ses affiliations professionnelles et éducatives avec l'organisation, le rôle, le département et les dates. Idéal pour les systèmes d'information de recherche, la désambiguïsation des auteurs, les rapports institutionnels, les outils académiques et la recherche universitaire. Les iD ORCID proviennent des résultats de recherche ou sont fournis directement par le chercheur. Les données sont la partie publique des enregistrements ORCID (CC0). Pour les travaux académiques et le graphe de citations, voir l'API OpenAlex ; pour les DOI et les métadonnées de revues, l'API Crossref.

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3,573

L'Internet Archive en tant qu'API — la bibliothèque numérique à but non lucratif de plus de 40 millions d'articles librement accessibles : livres et textes, audio et concerts de musique live, films et vidéos, logiciels, images et pages web archivées. Recherchez l'intégralité des archives par mot-clé avec la syntaxe complète des champs Lucene (par créateur, titre, sujet, collection et plus), filtrez par type de média (textes, audio, films, image, logiciels, web, concerts live) et triez par téléchargements, date ou popularité tendance, obtenant l'identifiant, le titre, le créateur, le type de média, l'année, le nombre de téléchargements et les collections de chaque article ; lisez les métadonnées complètes d'un article, y compris sa description, ses créateurs, sujets, langue, collections, éditeur, licence, dates et taille totale ; listez les fichiers téléchargeables d'un article avec leur format, taille, durée et une URL de téléchargement direct ; et recherchez le snapshot le plus proche de la Wayback Machine de n'importe quelle page web — le drapeau archivé, la date du snapshot et le statut HTTP, ainsi que le lien web.archive.org, éventuellement près d'un horodatage cible. Idéal pour la recherche, la préservation numérique, la découverte de médias, la construction d'ensembles de données, la récupération de liens morts et les applications qui mettent en avant la culture du domaine public et sous licence ouverte. Données provenant de l'Internet Archive (archive.org).

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4,083

MetaboLights en tant qu'API, propulsé par EMBL-EBI — le premier référentiel ouvert au monde pour les expériences de métabolomique (spectroscopie RMN et spectrométrie de masse) et une ressource sœur de PRIDE pour la protéomique. Recherchez les études de métabolomique publiques par mot-clé (retournant l'accession, le titre, la description et l'organisme de chaque étude) ; lisez les métadonnées complètes d'une étude, y compris son résumé, son statut, ses dates de soumission et de publication, les descripteurs de conception d'étude, les facteurs expérimentaux, les analyses analytiques avec leur type de mesure, technologie et plateforme, les contributeurs et leurs rôles, les publications liées avec DOI et identifiants PubMed, les soumetteurs, le nombre d'échantillons, l'URL de téléchargement FTP et la licence des données ; inspectez le flux de travail analytique — chaque protocole avec son nom, son type, sa description et ses paramètres (collecte d'échantillons, extraction, chromatographie, spectroscopie RMN/MS, transformation des données et identification des métabolites) ; et listez les organismes et parties d'organismes étudiés avec leurs termes d'ontologie. Idéal pour la recherche en métabolomique et en biologie des systèmes, la réutilisation des ensembles de données et la méta-analyse, les pipelines bioinformatiques et les outils qui intègrent des preuves expérimentales. Les accessions d'étude ressemblent à MTBLS1. Données provenant d'EMBL-EBI MetaboLights.

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Europe PMC en tant qu'API, propulsé par EMBL-EBI — un référentiel ouvert de littérature biomédicale et en sciences de la vie couvrant plus de 45 millions de résumés et plus de 9 millions d'articles en texte intégral issus de PubMed, PubMed Central, serveurs de prépublication (bioRxiv et medRxiv), brevets et Agricola. Recherchez dans la littérature avec une syntaxe de champ riche (par auteur, titre, revue, terme MeSH, année de publication ou statut en libre accès), en ordonnant les résultats par pertinence, date ou nombre de citations, et en vous limitant éventuellement aux prépublications ; lisez les métadonnées complètes et le résumé d'un article — ses auteurs, revue, volume et pages, DOI, identifiants PubMed et PMC, termes MeSH, mots-clés, subventions de financement et liens vers le texte intégral gratuit ; et parcourez le réseau de citations dans les deux directions : les articles qui citent un document donné, et les travaux que ce document référence lui-même. Ensemble, ils vous permettent de mesurer l'impact scientifique, de construire des graphes de citations, de suivre un sujet de recherche à travers les prépublications et les articles évalués par les pairs, et d'alimenter des outils bibliométriques, de revue systématique et de veille scientifique. Les identifiants d'articles sont les identifiants PubMed (numériques), les identifiants PMC (PMC…) ou les identifiants de prépublication (PPR…) ; la source par défaut est PubMed (MED). Données provenant d'EMBL-EBI Europe PMC.

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L'archive protéomique PRIDE sous forme d'API, propulsée par l'archive PRIDE de l'EMBL-EBI — le plus grand dépôt public mondial de données de protéomique par spectrométrie de masse et membre fondateur de ProteomeXchange. Recherchez les expériences protéomiques publiques par mot-clé (renvoyant l'accession, le titre, les organismes, les maladies et les instruments de chaque projet) ; lisez les métadonnées complètes d'un projet, y compris sa description, ses mots-clés, ses organismes et parties d'organismes, ses instruments de spectrométrie de masse, ses logiciels, les modifications protéiques identifiées, les protocoles de traitement des échantillons et des données, les soumetteurs, les affiliations et la publication liée (DOI et PubMed) ; listez les fichiers de données d'un projet avec leur catégorie, format, taille et un lien de téléchargement direct ; et explorez les facettes — les maladies, organismes, instruments, types d'expériences, logiciels et pays représentés parmi les projets correspondants — pour la découverte. Idéal pour la recherche en protéomique et en biologie des systèmes, la réutilisation d'ensembles de données et la méta-analyse, les pipelines bioinformatiques et les outils intégrant des preuves expérimentales. Les accessions de projet ressemblent à PXD000001. Données de l'EMBL-EBI.

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4,443

Familles de protéines, domaines et sites fonctionnels sous forme d'API, propulsée par la base de données InterPro de l'EBI. InterPro classe les protéines en familles et identifie les domaines, répétitions et sites importants qu'elles contiennent, en combinant les signatures prédictives de nombreuses bases de données membres (Pfam, SMART, PROSITE, CDD, PANTHER, SUPERFAMILY, NCBIfam et plus) en une ressource intégrée unique. Recherchez une entrée InterPro — une famille, un domaine, une répétition, un site conservé/de liaison/actif ou une modification post-traductionnelle — avec sa description, ses termes Gene Ontology et les signatures des bases de données membres qui la définissent ; recherchez des entrées par nom et type ; lisez les métadonnées d'une protéine ; et, surtout, listez les entrées InterPro trouvées sur une protéine avec leurs positions de début et de fin, afin de visualiser l'architecture des domaines d'une protéine. Idéal pour l'annotation des protéines et la prédiction de fonctions, la génomique comparative, les pipelines de biologie structurale et de bioinformatique, ainsi que les outils de recherche et d'enseignement. Les identifiants d'entrée sont IPR suivis de six chiffres ; les identifiants de protéines sont des accessions UniProt. Données provenant d'EMBL-EBI.

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Associations cible médicamenteuse–maladie sous forme d'API, propulsées par la plateforme Open Targets. Open Targets intègre la génétique humaine, la génomique, la transcriptomique, les médicaments connus, les modèles animaux et la littérature scientifique pour évaluer systématiquement la force de l'association entre une cible (gène/protéine) et une maladie — les preuves qui sous-tendent la découverte moderne de médicaments. Recherchez parmi les cibles, les maladies et les médicaments ; consultez une cible pour son symbole approuvé, son biotype, sa fonction, sa localisation génomique et ses identifiants UniProt ainsi que les maladies auxquelles elle est le plus fortement associée et leurs scores d'association globaux ; consultez une maladie pour sa description, ses domaines thérapeutiques et ses principales cibles associées avec scores ; et consultez un médicament pour sa modalité, son stade clinique maximal, ses noms commerciaux, ses synonymes et ses mécanismes d'action. Idéal pour les pipelines de découverte de médicaments et d'identification de cibles, la recherche par domaine thérapeutique, la science des données biomédicales et les outils de veille pharmaceutique. Les identifiants de cibles sont les identifiants de gènes Ensembl, les identifiants de maladies sont les identifiants EFO/MONDO/Orphanet, les identifiants de médicaments sont les identifiants ChEMBL. Les données sont ouvertes (CC0).

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