#taxonomy

El árbol de la vida como una API — impulsado por el Árbol de la Vida Abierto, el proyecto que unifica árboles filogenéticos y taxonomías publicados en un único árbol sintético que abarca aproximadamente 2.3 millones de especies nombradas. Resuelva cualquier nombre científico a su taxón canónico e ID de la Taxonomía del Árbol Abierto (OTT) (con referencias cruzadas a NCBI, GBIF y otras fuentes); lea la clasificación de un taxón y su linaje completo de ancestros hasta el árbol (género, familia, orden, clase, …); y calcule el ancestro común más reciente (MRCA) de cualquier conjunto de especies — el corazón de la biología comparativa y las preguntas de "¿qué tan relacionados están estos organismos?". Desde Homo sapiens y los grandes simios hasta cualquier rama de plantas, hongos, animales y microbios, es ideal para biología, evolución, ecología, educación y herramientas de bioinformática. Una referencia de árbol evolutivo/filogenética — distinta de los datos de ocurrencia de especies (biodiversidad/GBIF), taxonomía marina (WoRMS) y bases de datos de secuencias. Datos abiertos del proyecto Árbol de la Vida Abierto (CC0).

api.oanor.com/opentol-api

El Registro Mundial de Especies Marinas (WoRMS) como API: el registro taxonómico autoritativo y curado por expertos de la vida marina mundial, mantenido por una red global de taxónomos. WoRMS proporciona los nombres científicos aceptados, autoridades de nomenclatura, estado taxonómico y sinonimia, clasificación completa y nombres vernáculos (comunes) para especies marinas. /v1/search?name=Orcinus orca busca especies por nombre científico (establezca fuzzy=true para coincidencia parcial, marine_only=true para restringir a taxones marinos), devolviendo para cada coincidencia el AphiaID (identificador estable de WoRMS), nombre aceptado, autoridad, rango, estado taxonómico, nombre válido y clasificación superior. /v1/species?id=137102 devuelve el registro completo de una especie por AphiaID: nombre y autoridad, estado, clasificación de reino a género, indicadores marino y salobre, y cita. /v1/classification?id=137102 devuelve el árbol taxonómico completo desde Biota hasta el taxón, rango por rango. /v1/vernaculars?id=137102 devuelve los nombres comunes con su idioma. Obtenga un AphiaID de /v1/search, luego consulte sus detalles, árbol o nombres comunes. Ideal para biología marina, ciencias pesqueras, ecología, acuicultura y armonización de datos de biodiversidad. Datos de WoRMS (CC BY). Esta es taxonomía y nomenclatura marina autoritativa, distinta de las bases de datos de ocurrencia de especies/biodiversidad (como GBIF) y de bases de datos de secuencias o genomas.

api.oanor.com/worms-api

La base de conocimiento de proteínas UniProt como API, impulsada por el servicio REST oficial de UniProt curado por EMBL-EBI, SIB y PIR. Busque cualquier proteína por su acceso UniProt para nombres de proteínas y genes, organismo, longitud, masa, función, palabras clave, términos de Gene Ontology (GO) y estructuras 3D de PDB vinculadas; realice búsquedas de texto completo de proteínas filtradas por organismo (ID de taxón NCBI) y estado de revisión Swiss-Prot; obtenga secuencias de aminoácidos con FASTA, peso molecular y suma de verificación CRC64; enumere características de secuencia como péptidos señal, cadenas, dominios, sitios activos y de unión, residuos modificados y variantes naturales, con un desglose por tipo; resuelva nodos de taxonomía NCBI con su linaje completo; y extraiga proteomas de referencia con recuentos de proteínas e IDs de ensamblaje del genoma. En todos los reinos de la vida, desde humanos hasta bacterias. Ideal para tuberías de bioinformática, herramientas de descubrimiento de fármacos y proteómica, paneles de análisis de secuencias, aplicaciones de investigación académica y chatbots de ciencias de la vida.

api.oanor.com/uniprot-api

Empareja nombres científicos o comunes de especies con el backbone taxonómico de GBIF (reino a especie), busca en el catálogo global de especies, obtén registros taxonómicos completos con nombres vernáculos y recupera observaciones de ocurrencia geolocalizadas. Ideal para aplicaciones de naturaleza, educación, investigación, conservación y ciencia ciudadana.

api.oanor.com/biodiversity-api