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API de InterPro

saludable 4,610 Suscriptoras

Familias de proteínas, dominios y sitios funcionales como una API, impulsada por la base de datos InterPro del EBI. InterPro clasifica las proteínas en familias e identifica los dominios, repeticiones y sitios importantes que contienen, combinando las firmas predictivas de muchas bases de datos miembro (Pfam, SMART, PROSITE, CDD, PANTHER, SUPERFAMILY, NCBIfam y más) en un único recurso integrado. Consulte una entrada de InterPro (una familia, dominio, repetición, sitio conservado/de unión/activo o modificación postraduccional) con su descripción, términos de Gene Ontology y las firmas de bases de datos miembro que la definen; busque entradas por nombre y tipo; lea los metadatos de una proteína; y, lo más útil, enumere las entradas de InterPro encontradas en una proteína junto con sus posiciones de inicio y fin, para que pueda ver la arquitectura de dominios de una proteína. Ideal para anotación de proteínas y predicción de funciones, genómica comparativa, tuberías de biología estructural y bioinformática, y herramientas de investigación y enseñanza. Los identificadores de entrada son IPR seguidos de seis dígitos; los identificadores de proteínas son accesiones de UniProt. Datos de EMBL-EBI.

#interpro #protein-domains #protein-families #bioinformatics #annotation #pfam #life-sciences
api.oanor.com/interpro-api
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Especificaciones legibles por máquina para que los agentes de IA puedan integrar este API.

/api/interpro-api/openapi.json
/api/interpro-api/llms.txt

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salud API

saludable
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  • 510 llamadas/mes
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  • Soporte por correo electrónico
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Pro

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API de Temperatura de Fusión del ADN — oanor API marketplace

API de Temperatura de Fusión del ADN

Matemáticas de ADN-oligo y PCR-primer como una API, calculadas local y determinísticamente. El endpoint tm calcula la temperatura de fusión de una secuencia de cebador de tres maneras: la regla de Wallace 2·(A+T) + 4·(G+C) para oligos cortos de hasta 13 nt, la fórmula GC de Marmur–Wallace 64.9 + 41·(nGC − 16.4)/N para los más largos, y la ajustada por sal 81.5 + 0.41·%GC − 675/N + 16.6·log10[Na+] para una concentración de sodio dada, y recomienda el método adecuado para la longitud — un ATGCATGC de ocho bases se funde a 24 °C según Wallace, un cebador de 20 bases con 50 % de GC a aproximadamente 51.8 °C según Marmur. El endpoint gc-content informa los porcentajes de GC y AT, los recuentos por base y el peso molecular de cadena sencilla. El endpoint reverse-complement devuelve el complemento, la reversa y el complemento reverso de una hebra. Las secuencias usan A/C/G/T (sin distinción de mayúsculas/minúsculas, se ignoran espacios en blanco) y [Na+] está en mol/L. Todo se calcula local y determinísticamente, por lo que es instantáneo y privado. Ideal para desarrolladores de aplicaciones de biología molecular, biotecnología, PCR, diseño de cebadores, bioinformática y automatización de laboratorio, calculadoras de oligos y cebadores, y software LIMS. Fórmulas de estimación para diseño de cebadores, no un sustituto de la termodinámica de vecinos más cercanos. Cálculo local puro — sin clave, sin servicio de terceros, instantáneo. En vivo, nada almacenado. 3 endpoints. Esto es temperatura de fusión de oligos; para frecuencias alélicas de genética de poblaciones use una API de genética.

api.oanor.com/dnamelt-api

 API de Secuencia de ADN — oanor API marketplace

API de Secuencia de ADN

Matemáticas de análisis de secuencias de ADN/ARN como API, calculadas local y deterministicamente. El endpoint analyze informa la longitud y composición de bases de una secuencia, el contenido GC y AT, el complemento, la reversa y el complemento reverso (la hebra opuesta leída 5'→3'), y el peso molecular aproximado de cadena simple. El endpoint translate transcribe ADN a ARNm (T→U) y lo traduce a proteína con el código genético estándar en el marco de lectura 1, 2 o 3, dando la secuencia de aminoácidos en código de una letra, la longitud de la proteína y el número de codones de parada. El endpoint melting estima la temperatura de fusión de un cebador con la regla de Wallace, 4·(G+C) + 2·(A+T), para oligos cortos y una fórmula básica ajustada por sal para los más largos. Las secuencias no distinguen entre mayúsculas y minúsculas ni espacios en blanco y aceptan A, C, G, T para ADN o U para ARN. Todo se calcula local y deterministicamente, por lo que es instantáneo y privado. Ideal para desarrolladores de aplicaciones de bioinformática, biología molecular, genómica y laboratorio, herramientas de diseño de cebadores e inspección de secuencias, y educación en biología. Cálculo local puro — sin clave, sin servicio de terceros, instantáneo. En vivo, nada almacenado. 3 endpoints. Esto es análisis de secuencias; para datos de ensamblaje de genomas use una API de genomas.

api.oanor.com/dna-api

 API de Ensamblajes Genómicos — oanor API marketplace

API de Ensamblajes Genómicos

Ensamblajes genómicos de referencia como una API — impulsada por NCBI Assembly, el registro de construcciones genómicas para organismos en todo el árbol de la vida. Busque ensamblajes por organismo (o texto libre) y consulte los metadatos de cualquier ensamblaje: su acceso (GCF_… RefSeq o GCA_… GenBank), nombre (ej. GRCh38.p14), organismo e ID de taxón, nivel de ensamblaje (genoma completo, cromosoma, andamio o contig), estadísticas de contigüidad (N50 de contig y andamio), cobertura de secuenciación, categoría RefSeq, nombres UCSC y Ensembl, la organización que lo envió, fecha de publicación y rutas de descarga FTP. Desde el genoma de referencia humano hasta cualquier microbio, planta o animal secuenciado, convierte el registro de ensamblajes genómicos en una API limpia de búsqueda y obtención. Un registro de ensamblajes genómicos — distinto de las bases de datos de secuencias (ENA), anotación genómica (Ensembl), variantes (ClinVar, dbVar) y expresión génica (GEO). Datos abiertos de NCBI Assembly (dominio público).

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 API de Expresión Génica — oanor API marketplace

API de Expresión Génica

Experimentos de genómica funcional como una API — impulsada por NCBI GEO (Gene Expression Omnibus), el repositorio público más grande de datos de expresión génica. GEO archiva series de expresión y conjuntos de datos curados de experimentos de microarreglos y secuenciación de alto rendimiento en todos los organismos. Busque experimentos por palabra clave y opcionalmente por organismo, y consulte cualquier serie o conjunto de datos para obtener sus metadatos: título, resumen, tipo de ensayo (perfil de expresión por microarreglo o por secuenciación), organismo, número de muestras, plataforma y la publicación detrás de él. Desde estudios de estrés de células β hasta transcriptómica del cáncer en humanos y ratones, convierte el archivo GEO en una API simple de búsqueda y obtención para transcriptómica, bioinformática y descubrimiento de datos de investigación. Un repositorio de conjuntos de datos de expresión génica / genómica funcional — distinto de las bases de datos de secuencia (ENA), variantes (ClinVar, dbVar), estructura (PDB) y ontología. Datos abiertos de NCBI GEO (dominio público).

api.oanor.com/geodatasets-api

Preguntas frecuentes

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¿Cómo obtengo una clave API para API de InterPro?
Regístrate gratis en oanor.com, genera una clave API desde el panel de desarrollador y llama a API de InterPro con la cabecera x-oanor-key. No se necesita tarjeta de crédito para el plan gratuito.
¿Cuál es el límite de velocidad de API de InterPro?
El plan gratuito permite 1 solicitud por segundo. Los planes de pago escalan hasta 50 solicitudes por segundo en el nivel Mega. Los límites rígidos devuelven HTTP 429 por encima de la cuota — sin cargos sorpresa por exceso.
¿Cuánto cuesta API de InterPro?
API de InterPro ofrece un plan gratuito con 100 llamadas / mes. Los planes de pago empiezan en €6.95 / mes con cuotas más altas y límites de tasa más rápidos.
¿Puedo cancelar mi suscripción en cualquier momento?
Sí. Los planes se facturan mensualmente y puedes cancelar en cualquier momento desde el panel de facturación. Sin contratos a largo plazo ni penalización por cancelación.
¿Cumple API de InterPro con el RGPD?
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curl https://api.oanor.com/interpro-api/SOME_PATH \
  -H "x-oanor-key: oanor_test_..."
const res = await fetch("https://api.oanor.com/interpro-api/SOME_PATH", {
  headers: { "x-oanor-key": "oanor_test_..." }
});
const data = await res.json();
$ch = curl_init("https://api.oanor.com/interpro-api/SOME_PATH");
curl_setopt($ch, CURLOPT_RETURNTRANSFER, true);
curl_setopt($ch, CURLOPT_HTTPHEADER, ["x-oanor-key: oanor_test_..."]);
$response = curl_exec($ch);
import requests
r = requests.get(
    "https://api.oanor.com/interpro-api/SOME_PATH",
    headers={"x-oanor-key": "oanor_test_..."},
)
print(r.json())

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