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InterPro API

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Proteinfamilien, Domänen und funktionelle Stellen als API, unterstützt durch die EBI InterPro-Datenbank. InterPro klassifiziert Proteine in Familien und identifiziert die Domänen, Wiederholungen und wichtigen Stellen, die sie enthalten, indem es die prädiktiven Signaturen vieler Mitgliedsdatenbanken (Pfam, SMART, PROSITE, CDD, PANTHER, SUPERFAMILY, NCBIfam und mehr) in einer einzigen integrierten Ressource zusammenfasst. Suchen Sie einen InterPro-Eintrag – eine Familie, Domäne, Wiederholung, konservierte/bindende/aktive Stelle oder posttranslationale Modifikation – mit seiner Beschreibung, Gene-Ontology-Begriffen und den Signaturen der Mitgliedsdatenbanken, die ihn definieren; durchsuchen Sie Einträge nach Name und Typ; lesen Sie die Metadaten eines Proteins; und, am nützlichsten, listen Sie die InterPro-Einträge auf, die auf einem Protein gefunden werden, zusammen mit ihren Start- und Endpositionen, sodass Sie die Domänenarchitektur eines Proteins sehen können. Ideal für Proteinannotation und Funktionsvorhersage, vergleichende Genomik, strukturbiologische und bioinformatische Pipelines sowie Forschungs- und Lehrmittel. Eintrags-IDs sind IPR gefolgt von sechs Ziffern; Protein-IDs sind UniProt-Zugriffsnummern. Daten von EMBL-EBI.

#interpro #protein-domains #protein-families #bioinformatics #annotation #pfam #life-sciences
api.oanor.com/interpro-api
API-Key holen Im Playground testen → Anbieter kontaktieren

Maschinenlesbare Spezifikation, damit KI-Agenten diese API integrieren können.

/api/interpro-api/openapi.json
/api/interpro-api/llms.txt

Discovery: GET /api/index.json listet alle APIs.

InterPro API — live data on the oanor API marketplace

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DNA-Schmelztemperatur-API — oanor API marketplace

DNA-Schmelztemperatur-API

DNA-Oligo- und PCR-Primer-Mathematik als API, lokal und deterministisch berechnet. Der tm-Endpunkt berechnet die Schmelztemperatur einer Primersequenz auf drei Arten: die Wallace-Regel 2·(A+T) + 4·(G+C) für kurze Oligos bis zu 13 nt, die Marmur-Wallace-GC-Formel 64.9 + 41·(nGC − 16.4)/N für längere, und die salzangepasste 81.5 + 0.41·%GC − 675/N + 16.6·log10[Na+] für eine gegebene Natriumkonzentration, und empfiehlt die richtige Methode für die Länge — ein achtbasiges ATGCATGC schmilzt bei 24 °C nach Wallace, ein 20-basiger 50 %-GC-Primer bei etwa 51,8 °C nach Marmur. Der gc-content-Endpunkt meldet die GC- und AT-Prozentsätze, die Anzahlen pro Base und das einzelsträngige Molekulargewicht. Der reverse-complement-Endpunkt gibt das Komplement, die Reverse und das Reverse-Komplement eines Strangs zurück. Sequenzen verwenden A/C/G/T (Groß-/Kleinschreibung nicht beachtet, Leerzeichen ignoriert) und [Na+] ist in mol/L. Alles wird lokal und deterministisch berechnet, daher ist es sofort und privat. Ideal für Entwickler von Molekularbiologie-, Biotech-, PCR-, Primerdesign-, Bioinformatik- und Laborautomatisierungs-Apps, Oligo- und Primer-Rechner sowie LIMS-Software. Schätzformeln für das Primerdesign, kein Ersatz für Nächste-Nachbarn-Thermodynamik. Reine lokale Berechnung — kein Schlüssel, kein Drittanbieterdienst, sofort. Live, nichts gespeichert. 3 Endpunkte. Dies ist die Oligo-Schmelztemperatur; für populationsgenetische Allelfrequenzen verwenden Sie eine Genetik-API.

api.oanor.com/dnamelt-api

 DNA Sequence API — oanor API marketplace

DNA Sequence API

DNA/RNA-Sequenzanalyse-Mathematik als API, lokal und deterministisch berechnet. Der Analyze-Endpunkt meldet die Länge und Basenzusammensetzung einer Sequenz, den GC- und AT-Gehalt, das Komplement, das Reverse und das reverse Komplement (der gegenüberliegende Strang gelesen 5'→3') sowie das ungefähre einzelsträngige Molekulargewicht. Der Translate-Endpunkt transkribiert DNA zu mRNA (T→U) und übersetzt sie mit dem Standard-Gencode in Leserahmen 1, 2 oder 3 in Protein, wobei die Ein-Buchstaben-Aminosäuresequenz, die Proteinlänge und die Anzahl der Stopp-Codons angegeben werden. Der Melting-Endpunkt schätzt die Schmelztemperatur eines Primers mit der Wallace-Regel, 4·(G+C) + 2·(A+T), für kurze Oligos und einer salzangepassten Grundformel für längere. Sequenzen sind Groß-/Kleinschreibungs- und Leerzeichen-unempfindlich und akzeptieren A, C, G, T für DNA oder U für RNA. Alles wird lokal und deterministisch berechnet, daher ist es sofort und privat. Ideal für Bioinformatik, Molekularbiologie, Genomik und Entwickler von Labor-Apps, Primer-Design- und Sequenzinspektionswerkzeuge sowie Biologieunterricht. Reine lokale Berechnung – kein Schlüssel, kein Drittanbieterdienst, sofort. Live, nichts gespeichert. 3 Endpunkte. Dies ist Sequenzanalyse; für Genomassemblierungsdaten verwenden Sie eine Genom-API.

api.oanor.com/dna-api

 Genome Assemblies API — oanor API marketplace

Genome Assemblies API

Referenz-Genomassemblies als API – unterstützt durch NCBI Assembly, das Register der Genombuilds für Organismen im gesamten Baum des Lebens. Durchsuchen Sie Assemblies nach Organismus (oder Freitext) und rufen Sie die Metadaten jedes Assemblies ab: seine Accession (GCF_… RefSeq oder GCA_… GenBank), Name (z. B. GRCh38.p14), Organismus und Taxon-ID, Assembly-Level (vollständiges Genom, Chromosom, Scaffold oder Contig), Kontiguitätsstatistiken (Contig- und Scaffold-N50), Sequenzierungsabdeckung, RefSeq-Kategorie, UCSC- und Ensembl-Namen, die einreichende Organisation, Veröffentlichungsdatum und FTP-Download-Pfade. Vom menschlichen Referenzgenom bis zu jedem sequenzierten Mikroben, Pflanze oder Tier verwandelt es das Genom-Assembly-Register in eine saubere Such- und Abruf-API. Ein Genom-Assembly-Register – unterschieden von Sequenz- (ENA), Genomannotation- (Ensembl), Varianten- (ClinVar, dbVar) und Genexpressionsdatenbanken (GEO). Offene Daten von NCBI Assembly (Public Domain).

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 Gene Expression API — oanor API marketplace

Gene Expression API

Funktionelle Genomik-Experimente als API — unterstützt von NCBI GEO (Gene Expression Omnibus), dem größten öffentlichen Repository für Genexpressionsdaten. GEO archiviert Expressionsserien und kuratierte Datensätze aus Microarray- und Hochdurchsatz-Sequenzierungsexperimenten aller Organismen. Durchsuchen Sie Experimente nach Stichwort und optional nach Organismus, und rufen Sie jede Serie oder jeden Datensatz ab, um deren Metadaten zu erhalten: Titel, Zusammenfassung, Assay-Typ (Expressionsprofilierung durch Array oder durch Sequenzierung), Organismus, Anzahl der Proben, Plattform und die zugrunde liegende Publikation. Von β-Zell-Stress-Studien bis hin zur Krebs-Transkriptomik bei Mensch und Maus verwandelt es das GEO-Archiv in eine einfache Such- und Abruf-API für Transkriptomik, Bioinformatik und Forschungsdaten-Entdeckung. Ein Repository für Genexpressions-/funktionelle Genomik-Datensätze — abgegrenzt von Sequenz- (ENA), Varianten- (ClinVar, dbVar), Struktur- (PDB) und Ontologie-Datenbanken. Offene Daten von NCBI GEO (Public Domain).

api.oanor.com/geodatasets-api

Häufig gestellte Fragen

Schnelle Antworten zu Preisen, Kontingenten und Integration.

Wie bekomme ich einen API-Key für InterPro API?
Registriere dich kostenlos auf oanor.com, erstelle einen API-Key im Entwickler-Dashboard und rufe InterPro API mit dem x-oanor-key-Header auf. Keine Kreditkarte für den Free-Tier nötig.
Wie hoch ist das Rate-Limit für InterPro API?
Der Free-Tier erlaubt 1 Anfrage pro Sekunde. Bezahlte Pläne skalieren bis zu 50 Anfragen pro Sekunde im Mega-Tier. Harte Limits liefern HTTP 429 oberhalb der Quote — keine überraschenden Mehrkosten.
Was kostet InterPro API?
InterPro API hat einen Free-Tier mit 100 Calls / Monat. Bezahlte Pläne starten bei €6.95 / Monat mit höheren Kontingenten und schnelleren Rate-Limits.
Kann ich mein Abo jederzeit kündigen?
Ja. Pläne werden monatlich abgerechnet und du kannst jederzeit in deinem Billing-Dashboard kündigen. Keine Mindestlaufzeit und keine Kündigungsgebühr.
Ist InterPro API DSGVO-konform?
Alle Anfragen an InterPro API laufen über unser EU-Gateway. Dein Upstream-API-Key verlässt nie unseren Server und es werden keine personenbezogenen Daten an den Upstream-Anbieter weitergegeben außer der Anfrage selbst.

Wähle einen Endpoint aus der Liste links — Details und Playground erscheinen hier.

Code-Snippets

Registrieren, um einen API-Key zu bekommen, dann jeden Pfad unter deinem Slug aufrufen.

curl https://api.oanor.com/interpro-api/SOME_PATH \
  -H "x-oanor-key: oanor_test_..."
const res = await fetch("https://api.oanor.com/interpro-api/SOME_PATH", {
  headers: { "x-oanor-key": "oanor_test_..." }
});
const data = await res.json();
$ch = curl_init("https://api.oanor.com/interpro-api/SOME_PATH");
curl_setopt($ch, CURLOPT_RETURNTRANSFER, true);
curl_setopt($ch, CURLOPT_HTTPHEADER, ["x-oanor-key: oanor_test_..."]);
$response = curl_exec($ch);
import requests
r = requests.get(
    "https://api.oanor.com/interpro-api/SOME_PATH",
    headers={"x-oanor-key": "oanor_test_..."},
)
print(r.json())

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