#crystallography

Röntgenkristallografie wiskunde als een API, lokaal en deterministisch berekend. Het hoek-eindpunt past de wet van Bragg toe, n·λ = 2·d·sinθ, om de diffractiehoek θ en de experimenteel geplotte 2θ te geven op basis van de interplanaire afstand van een kristal en de röntgengolflengte, standaard uitgaande van de gangbare Cu Kα-bron bij 0,15406 nm en rapporteert de hoogste waarneembare orde ⌊2d/λ⌋ — een vlakafstand van 0,2 nm diffracteert Cu Kα tot θ ≈ 22,65°, een 2θ-piek nabij 45,3°. Het afstand-eindpunt keert de wet om, d = n·λ/(2·sinθ), en leest de roosterafstand rechtstreeks af van een gemeten XRD-piek — het dagelijkse werk van het indexeren van een diffractiepatroon, dus een 2θ van 31,77° voor keukenzout geeft de 0,2814 nm (200) afstand. Het golflengte-eindpunt lost λ = 2·d·sinθ/n op om de bron te identificeren of te kalibreren. Lengtes worden ingevoerd in nanometers of ångström en hoeken in graden, en elke diffractieorde n wordt ondersteund. Alles wordt lokaal en deterministisch berekend, dus het is onmiddellijk en privé. Ideaal voor ontwikkelaars van apps voor materiaalkunde, kristallografie, mineralogie, XRD, halfgeleider- en vastestoffysica, roosterafstand- en patroonindexeringshulpmiddelen en laboratoriumsoftware. Zuivere lokale berekening — geen sleutel, geen dienst van derden, onmiddellijk. Live, niets opgeslagen. 3 eindpunten. Dit is reflectiegeometrie Bragg-diffractie met de 2d-factor; voor optische dubbelspleet- en roosterdiffractie gebruik een golfoptica diffractie API.

api.oanor.com/bragg-api

Kristalstructuren als API — aangedreven door de Crystallography Open Database (COD), de open, publiek-domein verzameling van meer dan 500.000 kristalstructuren van organische, anorganische, metaal-organische verbindingen en mineralen. Doorzoek de database op chemische formule (elke standaard schrijfwijze — TiO2, Al2O3, H2O — wordt automatisch genormaliseerd) of op vrije tekst over mineraalnamen, titels en opmerkingen, en bekijk vervolgens elke structuur om de volledige kristallografische gegevens te krijgen: chemische en celformule, ruimtegroep (Hermann-Mauguin en Hall), de volledige eenheidscel (a, b, c, alfa, bèta, gamma en volume), de bronpublicatie (titel, auteurs, tijdschrift, jaar, DOI) en een link naar het CIF-bestand. Van kwarts, calciet en diamant tot anatase, korund en diopsiet, het is ideaal voor materiaalkunde, vastestofchemie, mineralogie, kristallografie onderwijs en onderzoekstools. Dit is een kristalstructuur- en materialendatabase — verschillend van molecuul-eigenschap (chemie / PubChem) en eiwitstructuur (PDB) databases. Open data van de Crystallography Open Database (CC0 / publiek domein).

api.oanor.com/cod-api

De RCSB Protein Data Bank als API — 3D-macromoleculaire structuren van eiwitten, nucleïnezuren en complexen, aangedreven door de officiële RCSB PDB-gegevens en zoekdiensten. Haal een structuurinvoer op met de 4-karakter PDB-id voor de titel, experimentele methode (röntgen, cryo-EM, NMR), resolutie, trefwoorden, deponerings- en releasedatums, auteurs, primaire citatie en entiteit- & assemblage-aantallen; voer een full-text zoekopdracht uit over het hele archief die overeenkomende PDB-id's en het totale aantal hits retourneert; lees een polymeer-entiteit voor de eiwit- of nucleïnezuurnaam, één-letter sequentie, lengte, bronorganisme, ketens en gekoppelde UniProt-id's; lees een biologische assemblage voor de oligomere toestand, symmetrie en keten- & atoomtellingen; vermeld de liganden die in een structuur zijn gebonden met hun component-id's en namen; en zoek een chemische component (ligand) op code voor de formule, gewicht, SMILES en InChIKey. Ideaal voor structurele biologie en geneesmiddelenontdekkingstools, moleculaire viewers, bioinformatica-pijplijnen, onderwijsapps en onderzoeksdashboards.

api.oanor.com/pdb-api