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#crystallography

3 APIs con esta etiqueta

API de difracción de Bragg

Matemáticas de cristalografía de rayos X como API, calculadas local y determinísticamente. El endpoint de ángulo aplica la ley de Bragg, n·λ = 2·d·sinθ, para dar el ángulo de difracción θ y el 2θ graficado experimentalmente a partir del espaciado interplanar de un cristal y la longitud de onda de rayos X, por defecto usando la fuente común Cu Kα a 0.15406 nm e informando el orden más alto observable ⌊2d/λ⌋ — un espaciado planar de 0.2 nm difracta Cu Kα a θ ≈ 22.65°, un pico 2θ cerca de 45.3°. El endpoint de espaciado invierte la ley, d = n·λ/(2·sinθ), leyendo el espaciado de la red directamente de un pico XRD medido — la tarea cotidiana de indexar un patrón de difracción, así que un 2θ de 31.77° para la sal de mesa da el espaciado (200) de 0.2814 nm. El endpoint de longitud de onda resuelve λ = 2·d·sinθ/n para identificar o calibrar la fuente. Las longitudes se ingresan en nanómetros o ångström y los ángulos en grados, y se admite cualquier orden de difracción n. Todo se calcula local y determinísticamente, por lo que es instantáneo y privado. Ideal para desarrolladores de aplicaciones de ciencia de materiales, cristalografía, mineralogía, XRD, semiconductores y física del estado sólido, herramientas de espaciado de red e indexación de patrones, y software de laboratorio. Cálculo local puro — sin clave, sin servicio de terceros, instantáneo. En vivo, nada almacenado. 3 endpoints. Esta es difracción de Bragg en geometría de reflexión con el factor 2d; para difracción óptica de doble rendija y rejilla use una API de difracción de óptica ondulatoria.

api.oanor.com/bragg-api

API de Cristalografía

Estructuras cristalinas como API — impulsado por la Base de Datos Abierta de Cristalografía (COD), la colección abierta de dominio público de más de 500,000 estructuras cristalinas de compuestos orgánicos, inorgánicos, metalorgánicos y minerales. Busque en la base de datos por fórmula química (cualquier formato estándar — TiO2, Al2O3, H2O — se normaliza automáticamente) o por texto libre sobre nombres de minerales, títulos y comentarios, luego consulte cualquier estructura para obtener sus datos cristalográficos completos: fórmula química y de celda, grupo espacial (Hermann-Mauguin y Hall), la celda unitaria completa (a, b, c, alfa, beta, gamma y volumen), la publicación fuente (título, autores, revista, año, DOI) y un enlace al archivo CIF. Desde cuarzo, calcita y diamante hasta anatasa, corindón y diópsido, es ideal para ciencia de materiales, química del estado sólido, mineralogía, enseñanza de cristalografía y herramientas de investigación. Esta es una base de datos de estructuras cristalinas y materiales — distinta de las bases de datos de propiedades moleculares (química / PubChem) y de estructuras de proteínas (PDB). Datos abiertos de la Base de Datos Abierta de Cristalografía (CC0 / dominio público).

api.oanor.com/cod-api

API de PDB

El Banco de Datos de Proteínas RCSB como una API — estructuras macromoleculares 3D de proteínas, ácidos nucleicos y complejos, impulsado por los datos y servicios de búsqueda oficiales de RCSB PDB. Obtén una entrada de estructura por su ID de PDB de 4 caracteres para su título, método experimental (rayos X, crio-EM, RMN), resolución, palabras clave, fechas de depósito y publicación, autores, cita principal y recuentos de entidades y ensamblajes; realiza búsquedas de texto completo en todo el archivo devolviendo IDs de PDB coincidentes y el recuento total de resultados; lee una entidad polimérica para su nombre de proteína o ácido nucleico, secuencia de una letra, longitud, organismo fuente, cadenas e IDs de UniProt vinculados; lee un ensamblaje biológico para su estado oligomérico, simetría y recuentos de cadenas y átomos; lista los ligandos unidos en una estructura con sus IDs de componente y nombres; y busca cualquier componente químico (ligando) por código para su fórmula, peso, SMILES e InChIKey. Ideal para herramientas de biología estructural y descubrimiento de fármacos, visores moleculares, tuberías de bioinformática, aplicaciones educativas y paneles de investigación.

api.oanor.com/pdb-api