#ncbi

Συναρμολογήσεις γονιδιώματος αναφοράς ως API — με τη δύναμη του NCBI Assembly, του καταλόγου γονιδιωματικών κατασκευών για οργανισμούς σε όλο το δέντρο της ζωής. Αναζητήστε συναρμολογήσεις ανά οργανισμό (ή ελεύθερο κείμενο) και δείτε τα μεταδεδομένα οποιασδήποτε συναρμολόγησης: την πρόσβασή της (GCF_… RefSeq ή GCA_… GenBank), το όνομα (π.χ. GRCh38.p14), τον οργανισμό και το αναγνωριστικό taxon, το επίπεδο συναρμολόγησης (πλήρες γονιδίωμα, χρωμόσωμα, σκαλωσιά ή contig), στατιστικά συνέχειας (N50 contig και scaffold), κάλυψη αλληλούχισης, κατηγορία RefSeq, ονόματα UCSC και Ensembl, τον οργανισμό υποβολής, ημερομηνία κυκλοφορίας και διαδρομές λήψης FTP. Από το ανθρώπινο γονιδίωμα αναφοράς έως οποιονδήποτε αλληλουχημένο μικροοργανισμό, φυτό ή ζώο, μετατρέπει τον κατάλογο συναρμολογήσεων γονιδιώματος σε ένα καθαρό API αναζήτησης και λήψης. Ένας κατάλογος συναρμολογήσεων γονιδιώματος — διακριτός από βάσεις δεδομένων αλληλουχίας (ENA), γονιδιωματικής σχολιασμού (Ensembl), παραλλαγών (ClinVar, dbVar) και γονιδιακής έκφρασης (GEO). Ανοικτά δεδομένα από το NCBI Assembly (δημόσιος τομέας).

api.oanor.com/genomes-api

Το ClinVar ως API, υποστηριζόμενο από την Εθνική Βιβλιοθήκη Ιατρικής των ΗΠΑ μέσω των NCBI E-utilities. Το ClinVar είναι το δημόσιο αρχείο των σχέσεων μεταξύ ανθρώπινων γενετικών παραλλαγών και υγείας, καταγράφοντας την κλινική σημασία (ερμηνεία) κάθε παραλλαγής — είτε είναι Παθογόνο, Πιθανά παθογόνο, Αβέβαιης σημασίας, Πιθανά καλοήθες ή Καλοήθες — μαζί με τις καταστάσεις με τις οποίες σχετίζεται. Το /v1/search?gene=BRCA1 αναζητά στο ClinVar με σύμβολο γονιδίου ή με ελεύθερο κείμενο με q= (π.χ. μια ασθένεια ή έκφραση HGVS), επιστρέφοντας τον συνολικό αριθμό των ταιριαστών παραλλαγών και μια λίστα με αναγνωριστικά παραλλαγών ClinVar. Το /v1/variant?id=4852102 επιστρέφει μια περίληψη παραλλαγής: την πρόσβαση ClinVar (VCV…), τον τίτλο, τον τύπο παραλλαγής, τα ονόματα παραλλαγής και cDNA, την κλινική ταξινόμηση και την κατάσταση αναθεώρησης, τη(τις) σχετική(ές) κατάσταση(εις), το(τα) γονίδιο(α) και το κύριο γονίδιο, το χρωμόσωμα και τη θέση, την πρωτεϊνική αλλαγή και τη μοριακή συνέπεια, καθώς και έναν σύνδεσμο προς την εγγραφή ClinVar. Λάβετε ένα αναγνωριστικό παραλλαγής από το /v1/search και, στη συνέχεια, ανακτήστε τις λεπτομέρειές του. Ιδανικό για κλινικές-γονιδιωματικές και σχολιασμού παραλλαγών ροές εργασίας, εργαλεία σπάνιων ασθενειών και γενετικής συμβουλευτικής, και πίνακες ελέγχου έρευνας. Δεδομένα από το NCBI ClinVar (δημόσιος τομέας). Πρόκειται για κλινική ερμηνεία παραλλαγών — διακριτή από βάσεις δεδομένων συχνότητας αλληλόμορφων πληθυσμού (όπως το gnomAD) και από βάσεις δεδομένων πρωτεϊνών/αλληλουχιών. Παρακαλούμε διατηρήστε τα ποσοστά αιτημάτων σε λογικά επίπεδα σύμφωνα με την ορθή χρήση του NCBI.

api.oanor.com/clinvar-api

Αναζητήστε την παγκόσμια βιοϊατρική βιβλιογραφία και λάβετε καθαρά μεταδεδομένα άρθρων και περιλήψεις, με τη δύναμη της Εθνικής Βιβλιοθήκης Ιατρικής των ΗΠΑ μέσω των NCBI E-utilities. Αναζητήστε πάνω από 35 εκατομμύρια παραπομπές με λέξη-κλειδί με ταξινόμηση κατά συνάφεια ή ημερομηνία, αναζητήστε ένα ή περισσότερα άρθρα με αναγνωριστικό PubMed για τίτλο, συγγραφείς, περιοδικό, ημερομηνία δημοσίευσης, τόμο/τεύχος/σελίδες, DOI και τύπο δημοσίευσης, ή λάβετε το πλήρες κείμενο περίληψης για ένα άρθρο. Αξιόπιστα ανοιχτά δεδομένα επιστρέφονται ως καθαρό JSON μέσω ενός γρήγορου, αξιόπιστου API. Ιδανικό για εργαλεία υγείας-τεχνολογίας και κλινικά εργαλεία, φαρμακευτική έρευνα και έρευνα επιστημών ζωής, συστηματικές ανασκοπήσεις, διαχειριστές αναφορών και ακαδημαϊκές εφαρμογές.

api.oanor.com/pubmed-api