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API · /string-api

API STRING

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La base de données d'interactions protéine-protéine STRING sous forme d'API — le réseau curé et prédit d'associations fonctionnelles entre protéines, propulsé par l'API STRING officielle. Résolvez les noms de gènes ou de protéines en identifiants STRING avec annotations ; obtenez les principaux partenaires d'interaction d'une protéine avec un score de confiance combiné et des preuves par canal (expérimental, bases de données curées, co-expression, text-mining, fusion de gènes, voisinage et co-occurrence) ; construisez le réseau d'interactions entre un ensemble de protéines sous forme d'arêtes pondérées ; exécutez l'enrichissement fonctionnel d'un ensemble de gènes sur Gene Ontology, KEGG, Reactome, Pfam, InterPro et plus avec des valeurs p et des taux de fausses découvertes ; et évaluez l'homologie entre protéines. Couvre plus de 12 000 organismes (humain par défaut, taxon NCBI 9606). Idéal pour les pipelines de biologie des systèmes et de biologie des réseaux, l'analyse de jeux de gènes et de voies, la recherche de cibles médicamenteuses et de gènes de maladies, et les tableaux de bord bioinformatiques.

#string #protein-interactions #network-biology #systems-biology #bioinformatics #enrichment #life-sciences
api.oanor.com/string-api
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/api/string-api/openapi.json
/api/string-api/llms.txt

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API STRING — live data on the oanor API marketplace

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  • Plafond ferme (429 au-dessus du quota, pas de dépassement)
  • 345k appels/mois
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Connexes APIs

Autres APIs avec des balises qui se chevauchent.

API Pad — oanor API marketplace

API Pad

Remplit et aligne des chaînes de caractères sur une largeur cible. Le point de terminaison pad ajoute un caractère de remplissage au début, à la fin ou des deux côtés d'une valeur jusqu'à ce qu'elle atteigne la largeur demandée — remplir un nombre avec des zéros (7 → 007), aligner à droite une colonne de prix, centrer un titre, ou construire un champ de largeur fixe — avec n'importe quelle chaîne de remplissage (espace, 0, tiret, points) et un indicateur de troncature optionnel pour couper les valeurs déjà trop longues. Le point de terminaison align prend une liste entière de lignes (ou du texte séparé par des sauts de ligne) et remplit chaque ligne à une largeur commune, de sorte que les colonnes s'alignent dans les tableaux à largeur fixe, les mises en page ASCII, les reçus, les factures et les journaux. La largeur est comptée en points de code Unicode, donc les emoji et les lettres accentuées comptent chacun pour un et ne sont jamais divisés. Calcul local pur — pas de clé, pas de service tiers, instantané. En direct, rien n'est stocké. 3 points de terminaison. Ceci remplit à une largeur ; pour envelopper un texte long sur plusieurs lignes, utilisez une API de word-wrap, et pour convertir entre les styles de casse, utilisez une API de text-case.

api.oanor.com/pad-api

 API Text Tools — oanor API marketplace

API Text Tools

Une boîte à outils de textes rapide et entièrement locale : conversion entre 10 styles de casse (upper, lower, title, sentence, camelCase, PascalCase, snake_case, kebab-case, CONSTANT_CASE, dot.case), génération d'URLs optimisées pour le référencement, calcul de statistiques textuelles (nombre de mots, caractères, phrases, lignes et paragraphes, longueur moyenne des mots et temps de lecture), et production de texte factice lorem-ipsum par mots, phrases ou paragraphes. Calcul pur côté serveur, sans tiers amont, donc les réponses sont instantanées et toujours disponibles. Idéal pour CMS, éditeurs, outils de développement, formulaires et pipelines de contenu.

api.oanor.com/text-api

 API Interactions Protéiques — oanor API marketplace

API Interactions Protéiques

Réseaux d'interactions protéine-protéine sous forme d'API — propulsé par STRING, la base de données d'associations protéiques connues et prédites qui combine des preuves issues d'expériences de laboratoire, de bases de données de voies organisées, de co-expression génique, de contexte génomique et de fouille de texte automatisée en un seul score de confiance, à travers des milliers d'organismes. Obtenez les principaux partenaires d'interaction d'une protéine (chacun avec le score de confiance combiné et les sept sous-scores des canaux de preuve), le réseau d'interaction entre n'importe quel ensemble de protéines sous forme d'arêtes notées, et l'enrichissement fonctionnel pour un ensemble de gènes — les termes GO sur-représentés, les voies KEGG, les domaines Pfam et plus encore, chacun avec sa valeur p, son FDR et ses gènes membres. Passez des symboles de gènes (TP53) ou des identifiants STRING/Ensembl, pour l'humain (par défaut) ou toute espèce par identifiant taxonomique NCBI. C'est une pierre angulaire de la biologie des systèmes — idéal pour l'analyse de réseaux, la génomique fonctionnelle, les voies et les outils bioinformatiques. Une ressource de réseau d'interactions protéiques — distincte des voies biologiques (Reactome), des complexes protéiques organisés (Complex Portal) et des annotations Gene Ontology (QuickGO). Données ouvertes de STRING (CC BY 4.0).

api.oanor.com/stringdb-api

 API BioModels — oanor API marketplace

API BioModels

BioModels en tant qu'API, propulsé par EMBL-EBI — le plus grand référentiel mondial de modèles mathématiques curatés et publiés de systèmes biologiques. BioModels collecte des modèles computationnels (principalement en SBML, le langage de balisage de biologie des systèmes) du métabolisme, de la signalisation cellulaire, des réseaux de régulation génique, du cycle cellulaire, des processus pathologiques et de la physiologie, chacun lié à la publication évaluée par les pairs dont il est issu. /v1/search?query=glycolysis recherche dans le référentiel et renvoie l'identifiant de chaque modèle correspondant (tel que BIOMD0000000012), son nom, son format, son soumetteur et ses dates de soumission/modification. /v1/model?id=BIOMD0000000012 renvoie les métadonnées d'un modèle — son nom et sa description, le format d'encodage, l'approche de modélisation (par exemple, modèle d'équation différentielle ordinaire), le statut de curation, la publication sous-jacente (titre, revue, année, auteurs) et les fichiers du modèle. Les identifiants de modèle ressemblent à BIOMD0000000012 pour les modèles curatés ou MODEL1234567890 pour les soumissions non curatées ; obtenez-les à partir du point de terminaison de recherche. Idéal pour les outils de biologie des systèmes et de modélisation computationnelle, les flux de travail de recherche reproductible et de réutilisation de modèles, et l'enseignement. Données provenant d'EMBL-EBI BioModels (CC0). Il s'agit d'un référentiel de modèles computationnels / biologie des systèmes — distinct des bases de données de séquences (UniProt, ENA), de structures (PDB, AlphaFold), de voies et de variants (ClinVar).

api.oanor.com/biomodels-api

Questions fréquentes

Réponses rapides sur les tarifs, quotas et l'intégration.

Comment obtenir une clé API pour API STRING ?
Inscris-toi gratuitement sur oanor.com, génère une clé API depuis le tableau de bord développeur et appelle API STRING avec l'en-tête x-oanor-key. Aucune carte bancaire requise pour le forfait gratuit.
Quelle est la limite de débit de API STRING ?
Le forfait gratuit permet 1 requête par seconde. Les forfaits payants montent jusqu'à 50 requêtes par seconde sur le palier Mega. Les limites strictes renvoient HTTP 429 au-delà du quota — sans frais surprises.
Combien coûte API STRING ?
API STRING dispose d'un forfait gratuit avec 100 appels / mois. Les forfaits payants commencent à €7.15 / mois avec des quotas plus élevés et des limites de débit plus rapides.
Puis-je résilier mon abonnement à tout moment ?
Oui. Les abonnements sont facturés mensuellement et tu peux résilier à tout moment depuis le tableau de bord de facturation. Aucun engagement à long terme ni frais de résiliation.
API STRING est-il conforme au RGPD ?
Toutes les requêtes vers API STRING transitent par notre passerelle européenne. Ta clé API upstream ne quitte jamais notre serveur et aucune donnée personnelle n'est partagée avec le fournisseur upstream au-delà de la requête envoyée.

Choisissez un point de terminaison dans la liste de gauche pour voir ses détails et essayez-le.

Extraits de code

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curl https://api.oanor.com/string-api/SOME_PATH \
  -H "x-oanor-key: oanor_test_..."
const res = await fetch("https://api.oanor.com/string-api/SOME_PATH", {
  headers: { "x-oanor-key": "oanor_test_..." }
});
const data = await res.json();
$ch = curl_init("https://api.oanor.com/string-api/SOME_PATH");
curl_setopt($ch, CURLOPT_RETURNTRANSFER, true);
curl_setopt($ch, CURLOPT_HTTPHEADER, ["x-oanor-key: oanor_test_..."]);
$response = curl_exec($ch);
import requests
r = requests.get(
    "https://api.oanor.com/string-api/SOME_PATH",
    headers={"x-oanor-key": "oanor_test_..."},
)
print(r.json())

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