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Polygenic Scores API

Polygene (Risiko-)Scores als API – betrieben durch den NHGRI-EBI PGS Catalog, die offene Datenbank veröffentlichter polygener Scores: gewichtete Kombinationen genetischer Varianten, die verwendet werden, um die genetische Veranlagung einer Person für eine Eigenschaft oder Krankheit zu schätzen. Durchsuchen Sie Eigenschaften nach Namen, um ihre Ontologie-IDs zu finden, listen Sie jeden polygenen Score auf, der für eine Eigenschaft entwickelt wurde, und lesen Sie die vollständigen Metadaten eines Scores – die berichteten und zugeordneten (EFO/MONDO) Eigenschaften, die Anzahl der Varianten im Score, die Entwicklungsmethode, das Genom-Build, die Abstammungsverteilung der Stichproben, auf denen er erstellt und evaluiert wurde, die zugrunde liegende Publikation (Titel, Zeitschrift, Datum, PubMed-ID), das Veröffentlichungsdatum, die Lizenz und einen direkten Link zur Score-Datei. Von Brustkrebs und koronarer Herzkrankheit bis zu Typ-2-Diabetes und BMI ist es ideal für statistische Genetik, Genomik, Risikovorhersage-Forschung und Bioinformatik-Tools. Eine Ressource für polygene Scores / genetische Risikovorhersage – unterschieden von Einzelvarianten-Assoziationsstudien (GWAS Catalog), populationsbezogenen Allelfrequenzen (gnomAD) und klinischer Varianteninterpretation (ClinVar). Offene Daten aus dem NHGRI-EBI PGS Catalog (CC BY 4.0).

#polygenic-scores #genomics #genetics
P von PremiumApi
Uptime
100.0%
Latenz
229ms
Subs
4,398
Server-geprüft 12 Probes/24h

api.oanor.com/pgs-api

BioSamples API

BioSamples als API, betrieben von EMBL-EBI – die Datenbank, die die Metadaten biologischer Proben speichert und verknüpft, die physischen Exemplare hinter biologischen Experimenten. Eine Probe in BioSamples trägt eine stabile Zugangsnummer (wie SAMEA3231268) und eine umfangreiche Reihe von Merkmalen – Organismus, Gewebe oder Organbestandteil, Zelltyp, Geschlecht, Krankheit, Entwicklungsstadium, Stamm und alle vom Einreicher bereitgestellten Attribute – und wird von anderen EBI-Archiven referenziert, darunter das European Nucleotide Archive (ENA), ArrayExpress und PRIDE. /v1/search?q=liver durchsucht Proben nach Freitext und gibt für jede Übereinstimmung die Zugangsnummer, den Namen, den Organismus und das Veröffentlichungsdatum zurück. /v1/sample?id=SAMEA3231268 gibt die Metadaten einer Probe zurück – ihre Zugangsnummer, ihren Namen, die NCBI-Taxon-ID, den Organismus, das Veröffentlichungs- und Aktualisierungsdatum, die Anzahl der Beziehungen zu anderen Proben und ihre Merkmale, reduziert auf eine saubere Schlüssel→Wert-Zuordnung. Zugangsnummern sehen aus wie SAMEA…, SAMN… oder SAMD…; erhalten Sie eine vom Such-Endpunkt. Ideal für die Integration lebenswissenschaftlicher Daten, Probenverfolgung, Metadatenharmonisierung und die Verknüpfung von Sequenzierungs- oder Expressionsdaten mit ihrem Ursprungsexemplar. Daten von EMBL-EBI BioSamples (öffentlich). Dies ist ein Register für biologische Probenmetadaten – zu unterscheiden von Studien- (BioStudies), Sequenz- (ENA), Varianten- (ClinVar) und Strukturdatenbanken.

#biosamples #samples #embl-ebi
P von PremiumApi
Uptime
100.0%
Latenz
375ms
Subs
4,634
Server-geprüft 9 Probes/24h

api.oanor.com/biosamples-api