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Mercado API

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API de Interacciones de Proteínas

Redes de interacción proteína-proteína como una API — impulsada por STRING, la base de datos de asociaciones de proteínas conocidas y predichas que combina evidencia de experimentos de laboratorio, bases de datos de rutas curadas, coexpresión génica, contexto genómico y minería de texto automatizada en una sola puntuación de confianza, en miles de organismos. Obtenga los principales socios de interacción de una proteína (cada uno con la puntuación de confianza combinada y las siete subpuntuaciones de canales de evidencia), la red de interacción entre cualquier conjunto de proteínas como aristas puntuadas y el enriquecimiento funcional para un conjunto de genes: los términos GO sobrerrepresentados, las rutas KEGG, los dominios Pfam y más, cada uno con su valor p, FDR y genes miembros. Pase símbolos de genes (TP53) o identificadores STRING/Ensembl, para humanos (por defecto) o cualquier especie por ID de taxón NCBI. Es una piedra angular de la biología de sistemas — ideal para análisis de redes, genómica funcional, rutas y herramientas de bioinformática. Un recurso de redes de interacción de proteínas — distinto de las rutas biológicas (Reactome), los complejos proteicos curados (Complex Portal) y las anotaciones de ontología génica (QuickGO). Datos abiertos de STRING (CC BY 4.0).

#protein-interactions #genomics #systems-biology
P por PremiumApi
Disponibilidad
100.0%
Latencia
470ms
Suscriptores
4,536
Verificado por servidor 12 sondas/24h

api.oanor.com/stringdb-api

API de Puntuaciones Poligénicas

Puntuaciones poligénicas (de riesgo) como API — impulsado por el Catálogo PGS de NHGRI-EBI, la base de datos abierta de puntuaciones poligénicas publicadas: combinaciones ponderadas de variantes genéticas utilizadas para estimar la predisposición genética de una persona a un rasgo o enfermedad. Busque rasgos por nombre para encontrar sus identificadores de ontología, enumere cada puntuación poligénica desarrollada para un rasgo y lea los metadatos completos de una puntuación: los rasgos informados y mapeados (EFO/MONDO), el número de variantes en la puntuación, el método de desarrollo, la versión del genoma, la distribución de ascendencia de las muestras en las que se construyó y evaluó, la publicación detrás de ella (título, revista, fecha, ID de PubMed), la fecha de publicación, la licencia y un enlace directo al archivo de puntuación. Desde cáncer de mama y enfermedad de las arterias coronarias hasta diabetes tipo 2 e IMC, es ideal para genética estadística, genómica, investigación de predicción de riesgos y herramientas bioinformáticas. Un recurso de puntuación poligénica / predicción de riesgo genético — distinto de los estudios de asociación de variantes individuales (Catálogo GWAS), frecuencias alélicas poblacionales (gnomAD) e interpretación de variantes clínicas (ClinVar). Datos abiertos del Catálogo PGS de NHGRI-EBI (CC BY 4.0).

#polygenic-scores #genomics #genetics
P por PremiumApi
Disponibilidad
100.0%
Latencia
229ms
Suscriptores
4,398
Verificado por servidor 12 sondas/24h

api.oanor.com/pgs-api

API de BioSamples

BioSamples como API, impulsado por EMBL-EBI — la base de datos que almacena y vincula los metadatos de muestras biológicas, los especímenes físicos detrás de los experimentos biológicos. Una muestra en BioSamples lleva un acceso estable (como SAMEA3231268) y un rico conjunto de características — organismo, tejido o parte del organismo, tipo celular, sexo, enfermedad, etapa de desarrollo, cepa y cualquier atributo proporcionado por el remitente — y es referenciada por otros archivos de EBI, incluidos el Archivo Europeo de Nucleótidos (ENA), ArrayExpress y PRIDE. /v1/search?q=liver busca muestras por texto libre y devuelve el acceso, nombre, organismo y fecha de publicación de cada coincidencia. /v1/sample?id=SAMEA3231268 devuelve los metadatos de una muestra — su acceso, nombre, ID de taxón de NCBI, organismo, fechas de publicación y actualización, el número de relaciones con otras muestras, y sus características aplanadas en un mapa limpio clave→valor. Los accesos tienen el formato SAMEA…, SAMN… o SAMD…; obtenga uno desde el endpoint de búsqueda. Ideal para integración de datos de ciencias de la vida, seguimiento de muestras, armonización de metadatos y vinculación de datos de secuenciación o expresión con su espécimen fuente. Datos de EMBL-EBI BioSamples (público). Este es un registro de metadatos de muestras biológicas — distinto de las bases de datos de estudios (BioStudies), secuencias (ENA), variantes (ClinVar) y estructuras.

#biosamples #samples #embl-ebi
P por PremiumApi
Disponibilidad
100.0%
Latencia
375ms
Suscriptores
4,634
Verificado por servidor 9 sondas/24h

api.oanor.com/biosamples-api